RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 GGA2Q9UJY4 613 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 CACNA1BQ00975 2339 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 METTL12A8MUP2 240 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 MOCS3O95396 460 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 IGLV3-25P01717 112 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 APOEP02649 317 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 ASLP04424 464 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 CEACAM1P13688 526 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 GNSP15586 552 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 ENGP17813 658 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 PRKCHP24723 683 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 SLC6A4P31645 630 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 CLCN1P35523 988 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 TPMTP51580 245 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 COPAP53621 1224 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 ST8SIA6P61647 398 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 ZBTB16Q05516 673 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 PDCLQ13371 301 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 SLC12A1Q13621 1099 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 DCAF6Q58WW2 860 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 MS4A13Q5J8X5 152 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 NADSYN1Q6IA69 706 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 MFN1Q8IWA4 741 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 FAM71AQ8IYT1 594 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 KDM1BQ8NB78 822 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 LMLNQ96KR4 655 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 PPP1R9BQ96SB3 815 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 CAPN10Q9HC96 672 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 SIX2Q9NPC8 291 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 ACP6Q9NPH0 428 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 RRN3Q9NYV6 651 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 STIM2Q9P246 746 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 CEP83Q9Y592 693 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 KCNJ18B7U540 433 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 H0Y626 953 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 ARHGAP33O14559 1287 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 HSF2BPO75031 334 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 CFIP05156 583 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 HLA-EP13747 358 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 ABCB4P21439 1286 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 TACR2P21452 398 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 CCR1P32246 355 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 CD70P32970 193 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 NOS2P35228 1153 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 SGSHP51688 502 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 PLK1P53350 603 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 OXCT1P55809 520 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 RPS24P62847 133 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 SLC6A3Q01959 620 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 APBA1Q02410 837 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 KCNMA1Q12791 1236 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 KCNJ12Q14500 433 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 ARID5BQ14865 1188 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 TAF5Q15542 800 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 PTPRNQ16849 979 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 UAP1L1Q3KQV9 507 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 DPCR1Q3MIW9 517 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 MIIPQ5JXC2 388 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 OR6B2Q6IFH4 312 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 TAC4Q86UU9 113 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 LGI2Q8N0V4 545 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 DEFB106AQ8N104 65 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRF-210ENST00000463041 CFAP52Q8N1V2 620 aa7.54□□□□□ -1.2
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