RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460211.5

ATG4B-213, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-213ENST00000460211 KCNU1A8MYU2 1149 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 PRRT4C9JH25 899 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 F5H5T6 163 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 SGK1O00141 431 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 GFRA2O00451 464 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 CALB1P05937 261 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 TNFAIP3P21580 790 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 MMP8P22894 467 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 MS4A13Q5J8X5 152 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 SFMBT2Q5VUG0 894 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 IL31Q6EBC2 164 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 ARCQ7LC44 396 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 CHSY1Q86X52 802 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 CIPCQ9C0C6 399 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 TSPY26PQ9H489 355 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 WDCPQ9H6R7 721 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 ELOVL2Q9NXB9 296 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 ADAM22Q9P0K1 906 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 STIM2Q9P246 746 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 RPP40O75818 363 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 UNGP13051 313 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 HOXB2P14652 356 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 TACR2P21452 398 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 SLC6A4P31645 630 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 SULT1E1P49888 294 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 DEUP1Q05D60 604 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 ASIC2Q16515 512 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 GEN1Q17RS7 908 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 C2CD6Q53TS8 623 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 BRMS1LQ5PSV4 323 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 RAP1GAP2Q684P5 730 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 NADSYN1Q6IA69 706 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 ANO7Q6IWH7 933 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 MFN1Q8IWA4 741 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 LGI2Q8N0V4 545 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 PGBD3Q8N328 593 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 SLC30A5Q8TAD4 765 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 GAB3Q8WWW8 586 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 BAP1Q92560 729 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 IQCDQ96DY2 449 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 P2RY11Q96G91 374 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 NPY6RQ99463 290 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 C11orf70Q9BRQ4 267 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 CLEC4EQ9ULY5 219 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 PLA2G4CQ9UP65 541 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 FAM170AA1A519 330 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 ANTXRLA6NF34 631 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 LRRC53A6NM62 1247 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 ADAM23O75077 832 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 WASP42768 502 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 CENPCQ03188 943 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 CDH18Q13634 790 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 STARD3Q14849 445 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 NFKBIBQ15653 356 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 FIGNQ5HY92 759 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 RABGAP1LQ5R372 815 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 C11orf74Q86VG3 221 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 RASSF3Q86WH2 238 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 AHI1Q8N157 1196 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 CARNMT1Q8N4J0 409 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 FIBINQ8TAL6 211 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 NT5C3BQ969T7 300 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 PCDHB18PQ96TA0 734 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 RXFP3Q9NSD7 469 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 ABCB8Q9NUT2 735 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 AIPL1Q9NZN9 384 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 GGA2Q9UJY4 613 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 TMEM59LQ9UK28 342 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-213ENST00000460211 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-213ENST00000460211 ANKRD62A6NC57 917 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-213ENST00000460211 H0Y626 953 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-213ENST00000460211 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms