RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFSF14O43557 240 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FSBPO95073 299 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SETSIPP0DME0 302 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD19P15391 556 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD27P26842 260 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAOAP59103 153 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT85P78386 507 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBWD6Q4V339 395 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBWD3Q5JTY5 395 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBWD5Q5RIA9 395 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRBA2Q6ZNG9 492 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WFDC5Q8TCV5 224 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD13Q8WZ19 329 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA1Q92805 767 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCUBE2Q9NQ36 999 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNGB3Q9NQW8 809 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGSF10Q6WRI0 2623 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KNL1Q8NG31 2342 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H0Y8X5 98 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 O00370 1275 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNK3O14649 394 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGA12O60330 932 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBL1XO60907 577 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD70P32970 193 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTSKP43235 329 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPP7Q5T2T1 576 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCERG1LQ5VWI1 586 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSANTD2Q6P1R3 559 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MARCH9Q86YJ5 346 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCML4Q8N228 414 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENGASEQ8NFI3 743 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBA3Q8TBC4 463 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ORAI3Q9BRQ5 295 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUN2Q9UH99 717 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COQ4Q9Y3A0 265 aa13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRAK2O43187 625 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV3-27P01718 113 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VDRP11473 427 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCP1P13796 627 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL9RQ01113 521 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAMK2BQ13554 666 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INAVAQ3KP66 663 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKDCCQ504Y2 493 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIK3R6Q5UE93 754 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUGGCQ68CJ6 796 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFWD3Q6PCD5 774 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP30Q70CQ3 517 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFN1Q8IWA4 741 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBR7Q8N806 425 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO19Q96H55 970 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCML1Q9UN30 329 aa13.69□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM149AA5PLN7 773 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRABD2BA6NFA1 517 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV4-34P06331 123 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC6A4P31645 630 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC11A2P49281 568 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RACK1P63244 317 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP4F3Q08477 520 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC157Q569K6 752 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNT1Q5JUK3 1230 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA0895LQ68EN5 471 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNC45BQ8IWX7 931 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRGQQ8WZA9 623 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LMLNQ96KR4 655 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTG2Q9H4K7 406 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FTSJ1Q9UET6 329 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GTQ1 180 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PQ27 194 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PQ64 194 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DFNA5O60443 496 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSL4O60488 711 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIN3BO75182 1162 aa13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGS7P49802 495 aa13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms