RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420234.5

PUM2-205, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-205	ENST00000420234	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234		I3L4J1	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TNFRSF10C	O14798	259 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	RGS13	O14921	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	GFPT2	O94808	682 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	VNN1	O95497	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	EFEMP2	O95967	443 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ITIH2	P19823	946 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SOX5	P35711	763 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	MRE11	P49959	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ERVFC1	P60507	584 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ZBED6	P86452	979 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	LRMP	Q12912	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ADAM15	Q13444	863 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CNGA2	Q16280	664 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ASIC2	Q16515	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SHC3	Q92529	594 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	HSFY1	Q96LI6	401 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	IFNK	Q9P0W0	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TSC2	P49815	1807 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	HIDE1	A8MVS5	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234		F8VZ95	297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234		M0QYV0	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CAPN9	O14815	690 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PER2	O15055	1255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SH3BP5	O60239	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	UBOX5	O94941	541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CALB1	P05937	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CEACAM5	P06731	702 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	GLI1	P08151	1106 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms