RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 ARPINQ7Z6K5 226 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 CCDC103Q8IW40 242 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 TMEM159Q96B96 161 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 BDH2Q9BUT1 245 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 POPDC2Q9HBU9 364 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 IL17RBQ9NRM6 502 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 DEPDC5O75140 1603 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 APOC2P02655 101 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 OR1E1P30953 314 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 TUBP50607 506 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 PLCL1Q15111 1095 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 SLC30A10Q6XR72 485 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 DSG4Q86SJ6 1040 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 EID3Q8N140 333 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 MAGED4Q96JG8 741 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 APOL2Q9BQE5 337 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 BTBD10Q9BSF8 475 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 SALL3Q9BXA9 1300 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 UGT2B28Q9BY64 529 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 NFASCO94856 1347 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 H3BMM5 538 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 KATNA1O75449 491 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 AMHP03971 560 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 NME5P56597 212 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 FGD2Q7Z6J4 655 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 KAT2BQ92831 832 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 CCDC3Q9BQI4 270 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 ATP13A1Q9HD20 1204 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 NDUFAF1Q9Y375 327 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 LACTBL1A8MY62 500 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 VAC14Q08AM6 782 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 STARD3Q14849 445 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 NINJ2Q9NZG7 142 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 TBKBP1A7MCY6 615 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 TRIM24O15164 1050 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 TRAF2Q12933 501 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 BMPR2Q13873 1038 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 POU6F1Q14863 301 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 CRYMQ14894 314 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 C11orf74Q86VG3 221 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 MIER2Q8N344 545 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 CCDC33Q8N5R6 958 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 CAPN10Q9HC96 672 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 HPS4Q9NQG7 708 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 MAPRE3Q9UPY8 281 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 CCDC154A6NI56 674 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 TSHRP16473 764 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 RPL21P46778 160 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 TUFMP49411 452 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 ATAD3BQ5T9A4 648 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 UNC93AQ86WB7 457 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 SETD9Q8NE22 299 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 WDR48Q8TAF3 677 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 HASPINQ8TF76 798 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 RAB21Q9UL25 225 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 FAM86B1E9PN63 330 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 BAIAP3O94812 1187 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 FAM86B2P0C5J1 330 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 JAK1P23458 1154 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 MGAT1P26572 445 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 HPCAL1P37235 193 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 PSEN2P49810 448 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 RAB14P61106 215 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 DDR2Q16832 855 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 CBWD3Q5JTY5 395 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 CBWD5Q5RIA9 395 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 DHFR2Q86XF0 187 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 ATG16L2Q8NAA4 619 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 ABCC13Q9NSE7 274 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 LRRC4BQ9NT99 713 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 CHADO15335 359 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 RGS14O43566 566 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 FAM58BPP0C7Q3 252 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 MYL4P12829 197 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 TNFRSF8P28908 595 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 GRK4P32298 578 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 PARP6Q2NL67 630 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 IQSEC1Q6DN90 963 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 MCOLN3Q8TDD5 553 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 ACTRT2Q8TDY3 377 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 SLC35C1Q96A29 364 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 ADPRHL2Q9NX46 363 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-205ENST00000419504 KLHL3Q9UH77 587 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms