RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC25Q86WR0 208 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 IQCKQ8N0W5 287 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 CNPY4Q8N129 248 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 FBXO32Q969P5 355 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 SERPINB11Q96P15 392 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 MTRRQ9UBK8 725 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 PLAAQ9Y263 795 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 CENPFP49454 3210 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 CDC14CA4D256 554 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 IRAK2O43187 625 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 URODP06132 367 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 ACRP10323 421 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 ETS1P14921 441 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 GOT1P17174 413 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 AMPD1P23109 780 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 ITGB8P26012 769 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 IVDP26440 423 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 OR1D2P34982 312 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 GLUD2P49448 558 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 GPR15P49685 360 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 TPI1P60174 286 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 DEFB103AP81534 67 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 CBX1P83916 185 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 DSG1Q02413 1049 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 CREMQ03060 361 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 FPGSQ05932 587 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 DUSP4Q13115 394 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 MORF4L2Q15014 288 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 PDK1Q15118 436 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 DENND2CQ68D51 928 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 RFX8Q6ZV50 586 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 SCD5Q86SK9 330 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 CROCCP2Q86T23 111 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 HOOK3Q86VS8 718 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 VWCEQ96DN2 955 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 RTP4Q96DX8 246 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 ZIM3Q96PE6 472 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 HAPLN3Q96S86 360 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 IL37Q9NZH6 218 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 GMIPQ9P107 970 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 PAK5Q9P286 719 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 RAD54BQ9Y620 910 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 ANK1P16157 1881 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 FAM92AA1XBS5 289 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 H3BQF6 201 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-211ENST00000415409 AGPSO00116 658 aa6.84□□□□□ -1.31
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