RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 DPYSL4O14531 572 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 GABBR2O75899 941 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 ZCCHC18P0CG32 403 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 AKAP5P24588 427 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 SERPINB9P50453 376 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 KRT81Q14533 505 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.632e-7■■■□□ 18.9
FAAP20-206ENST00000414253 MAP7D3Q8IWC1 876 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 GSDMBQ8TAX9 411 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 PPP2R3CQ969Q6 453 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 LPIN3Q9BQK8 851 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 APOL6Q9BWW8 343 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 HESX1Q9UBX0 185 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 USP1O94782 785 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 TGM2P21980 687 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 DBN1Q16643 649 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 MROH9Q5TGP6 573 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 SCYL2Q6P3W7 929 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 UNC93AQ86WB7 457 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 DNAJB3Q8WWF6 145 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 KLHL33A6NCF5 533 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 BUD23O43709 281 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 MAGEA3P43357 314 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 ARHGAP18Q8N392 663 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 SLC25A41Q8N5S1 370 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 DPEP3Q9H4B8 488 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 HEY1Q9Y5J3 304 aa25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 APOL1O14791 398 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 HCRTO43612 131 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 IL4RP24394 825 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 BCAR1P56945 870 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 MFSD10Q14728 455 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 PDK2Q15119 407 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 BOLA3Q53S33 107 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 TIFABQ6ZNK6 161 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 FAM172AQ8WUF8 416 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM40Q8WWA1 233 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 B3GNT5Q9BYG0 378 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 CPA4Q9UI42 421 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 MEI4A8MW99 385 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 SDC4P31431 198 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 OLFML2BQ68BL8 750 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 TLK2Q86UE8 772 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 ADGRF2Q8IZF7 708 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 PQLC3Q8N755 202 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 AZIN2Q96A70 460 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 SIGLEC10Q96LC7 697 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 S100A14Q9HCY8 104 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa25.24■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 ADAM17P78536 824 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 TUBB3Q13509 450 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 MORN1Q5T089 497 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 ARHGAP17Q68EM7 881 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 GSTCDQ8NEC7 633 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 PIRO00625 290 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 HUNKP57058 714 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 EFHC1Q5JVL4 640 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 RAPH1Q70E73 1250 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 C7orf31Q8N865 590 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 KLK14Q9P0G3 267 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 AXLP30530 894 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 SNX16P57768 344 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 PDE1BQ01064 536 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 MAP2K5Q13163 448 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 SNX17Q15036 470 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 FBXO47Q5MNV8 452 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 SLC9A4Q6AI14 798 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 C4orf22Q6V702 233 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF534Q76KX8 674 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 PDGFRBP09619 1106 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms