RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405636.6

TOMM40-202, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-202ENST00000405636 H3BRJ5 948 aa26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 TACR2P21452 398 aa26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 ARL4AP40617 200 aa26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 VIPR2P41587 438 aa26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 COPS2P61201 443 aa26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 Q6ZNB5 142 aa26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 RFX8Q6ZV50 586 aa26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 NETO2Q8NC67 525 aa26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 ACTRT1Q8TDG2 376 aa26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 HAUS1Q96CS2 278 aa26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 RNF157Q96PX1 679 aa26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 EPAS1Q99814 870 aa26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 FAM118BQ9BPY3 351 aa26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 AP1M1Q9BXS5 423 aa26.96■■□□□ 1.91
TOMM40-202ENST00000405636 E9PAM4 449 aa26.95■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 SP100P23497 879 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 SLC11A2P49281 568 aa26.95■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 PPP2R5EQ16537 467 aa26.95■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 MANEALQ5VSG8 457 aa26.95■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 BBS7Q8IWZ6 715 aa26.95■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 ZNF683Q8IZ20 524 aa26.95■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 IGSF8Q969P0 613 aa26.95■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 FAF2Q96CS3 445 aa26.95■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 LRRC3BQ96PB8 259 aa26.95■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 ARHGEF4Q9NR80 690 aa26.95■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 SOBPA7XYQ1 873 aa26.94■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 TSPAN3O60637 253 aa26.94■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 CST8O60676 142 aa26.94■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 PTPN7P35236 360 aa26.94■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 SGSHP51688 502 aa26.94■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 DPYSQ14117 519 aa26.94■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 FBXL22Q6P050 247 aa26.94■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 LGI2Q8N0V4 545 aa26.94■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 TMEM51Q9NW97 253 aa26.94■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 MPP6Q9NZW5 540 aa26.94■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 GRXCR2A6NFK2 248 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 EPHB2P29323 1055 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 CETN2P41208 172 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 MTHFRP42898 656 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 ZNF77Q15935 545 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 NPNTQ6UXI9 565 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 LRRN4CLQ8ND94 238 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 C1orf74Q96LT6 269 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 ASB16Q96NS5 453 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 L2HGDHQ9H9P8 463 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 CDH7Q9ULB5 785 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 DAPK3O43293 454 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 USP4Q13107 963 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 CFAP52Q8N1V2 620 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 CCDC33Q8N5R6 958 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 CARD6Q9BX69 1037 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 DOCK4Q8N1I0 1966 aa26.93■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 CNTN5O94779 1100 aa26.92■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 MAP3K6O95382 1288 aa26.92■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 ADGRF1Q5T601 910 aa26.92■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 HTR3DQ70Z44 454 aa26.92■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 SMARCD2Q92925 531 aa26.92■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 TBC1D31Q96DN5 1066 aa26.92■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 P2RY11Q96G91 374 aa26.92■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 DCLK3Q9C098 648 aa26.92■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 ZMYM5Q9UJ78 669 aa26.92■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 F5H5T6 163 aa26.91■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 ERCC2P18074 760 aa26.91■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 PAFAH1B1P43034 410 aa26.91■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 ALFQ53S48 1182 aa26.91■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 C1orf228Q6PIY5 440 aa26.91■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 PLD5Q8N7P1 536 aa26.91■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 ATG4AQ8WYN0 398 aa26.91■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 SUSD6Q92537 303 aa26.91■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 AZIN2Q96A70 460 aa26.91■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 GDE1Q9NZC3 331 aa26.91■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 FCARP24071 287 aa26.9■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 RPS24P62847 133 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 C2orf54Q08AI8 447 aa26.9■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa26.9■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 BBS12Q6ZW61 710 aa26.9■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 BHMTQ93088 406 aa26.9■■□□□ 1.9
TOMM40-202ENST00000405636 KRIT1O00522 736 aa26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms