RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 E9PAM4 449 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 LIASO43766 372 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 MOSPD3O75425 235 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 LATS1O95835 1130 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 ERCC2P18074 760 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 AVPR1AP37288 418 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 NTHL1P78549 312 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 C1orf228Q6PIY5 440 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 DENND1CQ8IV53 801 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 GRK7Q8WTQ7 553 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 HAUS1Q96CS2 278 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 COL6A3P12111 3177 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 MCF2LO15068 1137 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 IRF1P10914 325 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 HOXC13P31276 330 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 ADAM15Q13444 863 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 MANEALQ5VSG8 457 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 RAP1GAP2Q684P5 730 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 C14orf80Q86SX3 495 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 CHSY1Q86X52 802 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 AMACRQ9UHK6 382 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM187AA6NFU0 413 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 F5H5T6 163 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 DCLK1O15075 740 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 TACR2P21452 398 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 GGCXP38435 758 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 DR1Q01658 176 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 ADGRF1Q5T601 910 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 GPR149Q86SP6 731 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 RAD54BQ9Y620 910 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM2B-201ENST00000335523 GLP2RO95838 553 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 KLKB1P03952 638 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 SERPINB6P35237 376 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 KCNJ1P48048 391 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 XRCC4Q13426 336 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 GRIN2CQ14957 1233 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 NOMO1Q15155 1222 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 FBXL22Q6P050 247 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TTC27Q6P3X3 843 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 NPNTQ6UXI9 565 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 LZTR1Q8N653 840 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 DRGXA6NNA5 263 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 H7C0C1 242 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TRANK1O15050 2925 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 RAD51CO43502 376 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ECEL1O95672 775 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 GAS8O95995 478 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms