RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 NPNTQ6UXI9 565 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ATL2Q8NHH9 583 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 GKN1Q9NS71 199 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 DOCK4Q8N1I0 1966 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 FAM187AA6NFU0 413 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF197O14709 1029 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 MCF2LO15068 1137 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ACSL4O60488 711 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 GJA1P17302 382 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 KCNJ1P48048 391 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 LMNB2Q03252 620 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 PRSS36Q5K4E3 855 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ARTNQ5T4W7 220 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 LRRC31Q6UY01 552 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 RUBCNQ92622 972 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 PIDD1Q9HB75 910 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 CPQQ9Y646 472 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TTI1O43156 1089 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 MOSPD3O75425 235 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ECEL1O95672 775 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 PTGIRP43119 386 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 HYAL1Q12794 435 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 GPR158Q5T848 1215 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF683Q8IZ20 524 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 EFHBQ8N7U6 833 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 IGFLR1Q9H665 355 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TASP1Q9H6P5 420 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 LATS1O95835 1130 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 GAS8O95995 478 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ITGAVP06756 1048 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 IRF1P10914 325 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 GBE1Q04446 702 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TEAD2Q15562 447 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 RAP1GAP2Q684P5 730 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 C14orf80Q86SX3 495 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 CHSY1Q86X52 802 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 JAMLQ86YT9 394 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 DENND1CQ8IV53 801 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC114Q96M63 670 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 EPC1Q9H2F5 836 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 DTLQ9NZJ0 730 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 RAD54BQ9Y620 910 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 MFSD11O43934 449 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 GLP2RO95838 553 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 KLKB1P03952 638 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 RBP3P10745 1247 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 SERPINB6P35237 376 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 NTHL1P78549 312 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 SLC7A5Q01650 507 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 XRCC4Q13426 336 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TUBBP07437 444 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TACR2P21452 398 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 FBXL22Q6P050 247 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 OLFM3Q96PB7 478 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms