RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CNDP1Q96KN2 507 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SPATA13Q96N96 652 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 BIRC8Q96P09 236 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PFDN4Q9NQP4 134 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PICK1Q9NRD5 415 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 BTAF1O14981 1849 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NCAM2O15394 837 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 MAP3K13O43283 966 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TADA2AO75478 443 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 KCNA2P16389 499 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PEX2P28328 305 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RBL1P28749 1068 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 HMOX2P30519 316 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CPOXP36551 454 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 STX1BP61266 288 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 HPCAP84074 193 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SLC9A4Q6AI14 798 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 HIPK4Q8NE63 616 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TMEM143Q96AN5 459 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 COL20A1Q9P218 1284 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SEPT3Q9UH03 358 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 GPC4O75487 556 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CABYRO75952 493 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ALDH1A2O94788 518 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 MICAL2O94851 1124 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 FCGR1AP12314 374 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ITGAXP20702 1163 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 L1CAMP32004 1257 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PHKA2P46019 1235 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SLC26A2P50443 739 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SP4Q02446 784 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CCNIQ14094 377 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SFT2D3Q587I9 215 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CHST13Q8NET6 341 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 GCNAQ96QF7 691 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 MECRQ9BV79 373 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 MEI4A8MW99 385 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 C19orf81C9J6K1 198 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ACKR2O00590 384 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 AIM2O14862 343 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ZNF862O60290 1169 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 USP1O94782 785 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TGFB3P10600 412 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NPY2RP49146 381 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 INPP5AQ14642 412 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NXNQ6DKJ4 435 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 GPR141Q7Z602 305 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ZBTB33Q86T24 672 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.62□□□□□ -1.35
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