RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301281.10

UBXN6-201, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-201ENST00000301281 RAD54BQ9Y620 910 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 EPHB2P29323 1055 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 ARPP19P56211 112 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 TAS1R1Q7RTX1 841 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 PALM2Q8IXS6 379 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 GPR152Q8TDT2 470 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 FBF1Q8TES7 1133 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 CENPTQ96BT3 561 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 IL37Q9NZH6 218 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 FETUBQ9UGM5 382 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 OPHN1O60890 802 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 GPR17Q13304 367 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 ARTNQ5T4W7 220 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 MON1AQ86VX9 555 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 PPCSQ9HAB8 311 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 GMIPQ9P107 970 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 LTBP2Q14767 1821 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 FAM92AA1XBS5 289 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 F5H423 210 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 PAGE1O75459 146 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 CCR1P32246 355 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 GALNT2Q10471 571 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 RASA2Q15283 850 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF567Q8N184 647 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 HAPLN3Q96S86 360 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 TTPALQ9BTX7 342 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 TMEM120BA0PK00 339 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 KCNK1O00180 336 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 PIAS1O75925 651 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 EFEMP2O95967 443 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 FDFT1P37268 417 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 PPP2R5DQ14738 602 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 MANEALQ5VSG8 457 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 NLRP14Q86W24 1093 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 SERPINB11Q96P15 392 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 PLAC1Q9HBJ0 212 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 NCAM2O15394 837 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 UPP2O95045 317 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 BRAFP15056 766 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 HOXC13P31276 330 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 SERPINB6P35237 376 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 GRIA1P42261 906 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 TRABD2AQ86V40 505 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 HDAC11Q96DB2 347 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 PAFAH2Q99487 392 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 SIK2Q9H0K1 926 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 NUP205Q92621 2012 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 RASA4BC9J798 803 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 H7C4K7 107 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 NDUFAB1O14561 156 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 RASA4O43374 803 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 PTPN3P26045 913 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 PSMB4P28070 264 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 MPP2Q14168 576 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 VN1R3Q9BXE9 311 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 SPAG6O75602 509 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 C1QAP02745 245 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 MX2P20592 715 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 NR1H3Q13133 447 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN6-201ENST00000301281 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms