RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 KCNK1O00180 336 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 CCR1P32246 355 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 SEMA5AQ13591 1074 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 BRMS1LQ5PSV4 323 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF534Q76KX8 674 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 MAML1Q92585 1016 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 EPN3Q9H201 632 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 NEU3Q9UQ49 428 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 MYO16Q9Y6X6 1858 aa23.43■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 PAGE1O75459 146 aa23.43■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 GRIA1P42261 906 aa23.43■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 IKBKEQ14164 716 aa23.43■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 TDRPQ86YL5 185 aa23.43■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa23.43■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 WBP1LQ9NX94 342 aa23.43■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 STK10O94804 968 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 TPSB2P20231 275 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 TPSAB1Q15661 275 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF567Q8N184 647 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 MCUQ8NE86 351 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 HAPLN3Q96S86 360 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 IL37Q9NZH6 218 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 H7C4K7 107 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 DUSP4Q13115 394 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 CBLBQ13191 982 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 TADA2BQ86TJ2 420 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 SPPL2BQ8TCT7 592 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 FERMT1Q9BQL6 677 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 RAD54BQ9Y620 910 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 CDY1Q9Y6F8 540 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 ADAM12O43184 909 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 OPHN1O60890 802 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 YWHAQP27348 245 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF333Q96JL9 665 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINB11Q96P15 392 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 ACSS3Q9H6R3 686 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 CWH43Q9H720 699 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 FDFT1P37268 417 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 PPP2R5DQ14738 602 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO32Q969P5 355 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 SLC24A2Q9UI40 661 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM120BA0PK00 339 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 FAM92AA1XBS5 289 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 KCNU1A8MYU2 1149 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 NCAM2O15394 837 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 BRAFP15056 766 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 TSHRP16473 764 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 PSMB4P28070 264 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINB6P35237 376 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEA3P43357 314 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 GALNT2Q10471 571 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 ARTNQ5T4W7 220 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP36Q96G28 342 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 RASA4BC9J798 803 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 RASA4O43374 803 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 TBX18O95935 607 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 RPL17P18621 184 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 PTPN3P26045 913 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 GARSP41250 739 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 PID1Q7Z2X4 250 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 MPP5Q8N3R9 675 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 CENPTQ96BT3 561 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 HDAC11Q96DB2 347 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 PLXNA3P51805 1871 aa23.39■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 EFEMP2O95967 443 aa23.39■■□□□ 1.33
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