RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297979.9

C9orf3-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf3, Length 2,820 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-202ENST00000297979 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 STAT4Q14765 748 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 VPS52Q8N1B4 723 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 GPR152Q8TDT2 470 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 HAPLN3Q96S86 360 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 CCDC77Q9BR77 488 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 MTRRQ9UBK8 725 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 NUDT5Q9UKK9 219 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 BANF1O75531 89 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 AGTP01019 485 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 TIMP1P01033 207 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 EPHB2P29323 1055 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 MAGEA6P43360 314 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 GLUD2P49448 558 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 AP1B1Q10567 949 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 PPP2R5DQ14738 602 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 MSS51Q4VC12 460 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 FAXCQ5TGI0 409 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 FBXO32Q969P5 355 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 A0A0A0MRY4 1105 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 PSMD5Q16401 504 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 NETO2Q8NC67 525 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 CCNYQ8ND76 341 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 SPATA13Q96N96 652 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 COMMD8Q9NX08 183 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 NCAM2O15394 837 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 ITGB8P26012 769 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 SERPINB6P35237 376 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 PPP2R2AP63151 447 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 DUSP4Q13115 394 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 BBS9Q3SYG4 887 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 NPWQ8N729 165 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 P2RY11Q96G91 374 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 WDR27A2RRH5 827 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 PAGE1O75459 146 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 METTL18O95568 372 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 APRTP07741 180 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 CSF2RAP15509 400 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 DEFB103AP81534 67 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 SIK2Q9H0K1 926 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 A6NNZ2 444 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 RNF103O00237 685 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 ADAM12O43184 909 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 HTR7P34969 479 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 TP53INP2Q8IXH6 220 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 ZNF558Q96NG5 402 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 KIAA0355O15063 1070 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 OPHN1O60890 802 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 EFCAB14O75071 495 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 TPSB2P20231 275 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 MX2P20592 715 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 CD151P48509 253 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 TAF10Q12962 218 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-202ENST00000297979 TPSAB1Q15661 275 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms