RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM72DQ6L9T8 149 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM72BQ86X60 149 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF276Q8N554 614 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 MCUQ8NE86 351 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TLCD1Q96CP7 247 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 THAP11Q96EK4 314 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SERPINB12Q96P63 405 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TTLL2Q9BWV7 592 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 KLC2Q9H0B6 622 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TKTL2Q9H0I9 626 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PPCSQ9HAB8 311 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 NMUR1Q9HB89 426 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 COX16Q9P0S2 106 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 STK39Q9UEW8 545 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TSC2P49815 1807 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A0A0MRY4 1105 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNU1A8MYU2 1149 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 E7EVH7 732 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 RASGRF2O14827 1237 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 MTSS1O43312 755 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CREB3O43889 395 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 MFSD11O43934 449 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 OPHN1O60890 802 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 STK10O94804 968 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM63AO94886 807 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 AGTP01019 485 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 SOD2P04179 222 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 IVLP07476 585 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 LAG3P18627 525 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TPSB2P20231 275 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 SERPINB6P35237 376 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 FDFT1P37268 417 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR15P49685 360 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CDK16Q00536 496 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 DSG1Q02413 1049 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 SEMA5AQ13591 1074 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TPSAB1Q15661 275 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 MANEALQ5VSG8 457 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKRD22Q5VYY1 191 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TPGS2Q68CL5 300 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 PDIK1LQ8N165 341 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC39A11Q8N1S5 342 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM199Q8N511 208 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 LZTR1Q8N653 840 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CASP10Q92851 521 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC39A13Q96H72 371 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 C1orf74Q96LT6 269 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 PWWP2AQ96N64 755 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 SPATA13Q96N96 652 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF558Q96NG5 402 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 PHOX2BQ99453 314 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC77Q9BR77 488 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 SAYSD1Q9NPB0 183 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 FNIP2Q9P278 1114 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 OR12D3Q9UGF7 316 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 FETUBQ9UGM5 382 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 MAFFQ9ULX9 164 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.83□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 WASH4PA8MWX3 477 aa9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 TNFRSF10AO00220 468 aa9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 SPAG6O75602 509 aa9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 LRIG2O94898 1065 aa9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 UPP2O95045 317 aa9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 ACSL3O95573 720 aa9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 VAV1P15498 845 aa9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 RPIAP49247 311 aa9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 PGFP49763 221 aa9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 GYS2P54840 703 aa9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 USP46P62068 366 aa9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 GALNT2Q10471 571 aa9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 DUSP4Q13115 394 aa9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 AUHQ13825 339 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
APOBEC1-201ENST00000229304 PSMD5Q16401 504 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms