RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 ARMCX6Q7L4S7 300 aa22.58■■□□□ 1.21
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NME4-201ENST00000219479 VPS16Q9H269 839 aa22.58■■□□□ 1.21
NME4-201ENST00000219479 STIM2Q9P246 746 aa22.58■■□□□ 1.21
NME4-201ENST00000219479 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.58■■□□□ 1.21
NME4-201ENST00000219479 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.58■■□□□ 1.21
NME4-201ENST00000219479 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
NME4-201ENST00000219479 GGA2Q9UJY4 613 aa22.58■■□□□ 1.21
NME4-201ENST00000219479 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa22.58■■□□□ 1.21
NME4-201ENST00000219479 PLA2G4CQ9UP65 541 aa22.58■■□□□ 1.21
NME4-201ENST00000219479 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa22.57■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 HLA-FP30511 346 aa22.57■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 IL12RB1P42701 662 aa22.57■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 PTGER3P43115 390 aa22.57■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 CDK17Q00537 523 aa22.57■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 KRT31Q15323 416 aa22.57■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.57■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.57■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 SLC36A4Q6YBV0 504 aa22.57■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 SORCS1Q8WY21 1168 aa22.57■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 RNF34Q969K3 372 aa22.57■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.57■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.56■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 SLC6A4P31645 630 aa22.56■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 MYL5Q02045 173 aa22.56■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 CHST9Q7L1S5 443 aa22.56■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 AHI1Q8N157 1196 aa22.56■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 DEFB124Q8NES8 71 aa22.56■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 SLC39A13Q96H72 371 aa22.56■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 TMEM74BQ9NUR3 256 aa22.56■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 DDIT4Q9NX09 232 aa22.56■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 CYP8B1Q9UNU6 501 aa22.56■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 GRAP2O75791 330 aa22.55■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 SLC2A3P11169 496 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 CYP11B1P15538 503 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 LMAN2Q12907 356 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 CDH18Q13634 790 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 FUT11Q495W5 492 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 TAF3Q5VWG9 929 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 NADSYN1Q6IA69 706 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 CHSY1Q86X52 802 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 DEFB106AQ8N104 65 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 BTN2A3PQ96KV6 586 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 MRGPRX1Q96LB2 322 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 STK33Q9BYT3 514 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 PKD1L2Q7Z442 2459 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
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NME4-201ENST00000219479 ERBB2P04626 1255 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 ABCB4P21439 1286 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 MAPK8P45983 427 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 MS4A13Q5J8X5 152 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 TMEM215Q68D42 235 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 SYT12Q8IV01 421 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 CARNMT1Q8N4J0 409 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.24e-7■■□□□ 11.5
NME4-201ENST00000219479 MSANTD4Q8NCY6 345 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 SCNM1Q9BWG6 230 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-201ENST00000219479 CD248Q9HCU0 757 aa22.54■■□□□ 1.2
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