RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613894.3

CU633980.1-201, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CU633980.1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633980.1-201ENST00000613894 USP17L11C9JVI0 530 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 USP17L18D6R9N7 530 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 USP17L22D6RA61 530 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 USP17L19D6RCP7 530 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 USP17L20D6RJB6 530 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 CYB561D2O14569 222 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 ACOT8O14734 319 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 MEIS2O14770 477 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 RGS13O14921 159 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 KDM1AO60341 852 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 IFNB1P01574 187 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 ME2P23368 584 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 HSD17B4P51659 736 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 NOMO3P69849 1222 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 USP17L24Q0WX57 530 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 TRIM16LQ309B1 348 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 LINC00299Q6ZSB3 139 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 BBS12Q6ZW61 710 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 POLNQ7Z5Q5 900 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 NIPA2Q8N8Q9 360 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 KYQ8NBH2 561 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 RDH13Q8NBN7 331 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 GSDMBQ8TAX9 411 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 TANKQ92844 425 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 TAMM41Q96BW9 452 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 VRTNQ9H8Y1 702 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 CXorf21Q9HAI6 301 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 CREBZFQ9NS37 354 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 PARVAQ9NVD7 372 aa11.66□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 RGSL1A5PLK6 1076 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 TMEM191CA6NGB0 347 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 TNFRSF10AO00220 468 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 GIPC1O14908 333 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 SLC22A1O15245 554 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 CHADO15335 359 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 PIAS1O75925 651 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 TMEM191BP0C7N4 346 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 GLDCP23378 1020 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 MYF6P23409 242 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 KLRK1P26718 216 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 TM4SF1P30408 202 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 PSMD8P48556 350 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 PCYT1AP49585 367 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 CNTN2Q02246 1040 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 KCNJ11Q14654 390 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 AOC3Q16853 763 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 SMUG1Q53HV7 270 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 ITIH5Q86UX2 942 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 PEX5LQ8IYB4 626 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 MFSD2AQ8NA29 543 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 FBXL13Q8NEE6 735 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 CPA5Q8WXQ8 436 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 LRRC39Q96DD0 335 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 SORT1Q99523 831 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 TMEM79Q9BSE2 394 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 SLC13A1Q9BZW2 595 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 COQ10BQ9H8M1 238 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 CARD8Q9Y2G2 431 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 TIMM22Q9Y584 194 aa11.65□□□□□ -0.54
CU633980.1-201ENST00000613894 DYTNA2CJ06 578 aa11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 USP17L10C9JJH3 530 aa11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 FAM86B1E9PN63 330 aa11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 C6orf229H3BNL8 230 aa11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 K7ENM7 598 aa11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 GLRA3O75311 464 aa11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 TOM1L1O75674 476 aa11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 ERBB2P04626 1255 aa11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 ADRB2P07550 413 aa11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 GJC1P36383 396 aa11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 IREB2P48200 963 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 TRPC1P48995 793 aa11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 TMBIM6P55061 237 aa11.64□□□□□ -0.55
CU633980.1-201ENST00000613894 TAP1Q03518 808 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms