RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 CCDC172P0C7W6 258 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 GZMAP12544 262 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 SLC11A2P49281 568 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 TPM4P67936 248 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 KDSRQ06136 332 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 DMC1Q14565 340 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ARID5BQ14865 1188 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 CRY1Q16526 586 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 GEN1Q17RS7 908 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 C2orf27AQ580R0 203 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ACAD10Q6JQN1 1059 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 RFWD3Q6PCD5 774 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 WDR5BQ86VZ2 330 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ZNF683Q8IZ20 524 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 VCPIP1Q96JH7 1222 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 PIGVQ9NUD9 493 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 IFNKQ9P0W0 207 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 R4GN57 208 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ITIH6Q6UXX5 1313 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 EML5Q05BV3 1969 aa16.09■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 C2CD4BA6NLJ0 364 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 SGK1O00141 431 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 HRO43593 1189 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 TSPAN3O60637 253 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 CYBBP04839 570 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 SLC2A3P11169 496 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 HLA-FP30511 346 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 CCR1P32246 355 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 GBP1P32455 592 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ARID5AQ03989 594 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 LONP2Q86WA8 852 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 MCOLN2Q8IZK6 566 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ALLCQ8N6M5 410 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 MSANTD4Q8NCY6 345 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 FIBINQ8TAL6 211 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 WFDC5Q8TCV5 224 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 DDI1Q8WTU0 396 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ACDQ96AP0 544 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 IQCDQ96DY2 449 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 GABRG3Q99928 467 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 HAUS4Q9H6D7 363 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 SYNCQ9H7C4 482 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 DDIT4Q9NX09 232 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.08■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 A0A1W2PQF6 199 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 SIGLEC16A6NMB1 481 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 M0QYT0 321 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.166e-9■■■■□ 19.8
BECN1-211ENST00000589636 TIMM44O43615 452 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ADCY5O95622 1261 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 F9P00740 461 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 GYPCP04921 128 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 CNR2P34972 360 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 TIE1P35590 1138 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 MTA1Q13330 715 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 CCDC14Q49A88 953 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 BRMS1LQ5PSV4 323 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 SFMBT2Q5VUG0 894 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ASCL5Q7RTU5 278 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ADIPOR2Q86V24 386 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 C3orf20Q8ND61 904 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 JOSD2Q8TAC2 188 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 BHMTQ93088 406 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 C1orf74Q96LT6 269 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ACOX2Q99424 681 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 TBCBQ99426 244 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 EPC1Q9H2F5 836 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ADAM22Q9P0K1 906 aa16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 PRR23AA6NEV1 266 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 AP5Z1O43299 807 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 TACR2P21452 398 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 PTPN9P43378 593 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 FNTBP49356 437 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 SEC13P55735 322 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 RPS24P62847 133 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ZBED6P86452 979 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 C10orf76Q5T2E6 689 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 CCDC33Q8N5R6 958 aa16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
BECN1-211ENST00000589636 TTC17Q96AE7 1141 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms