RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 RIN3Q8TB24 985 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 IRGQQ8WZA9 623 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPH1Q92598 858 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ALG3Q92685 438 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CYLDQ9NQC7 956 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PIGVQ9NUD9 493 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DDIT4Q9NX09 232 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SCINQ9Y6U3 715 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM72CH0Y354 149 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO1FO00160 1098 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF185O15231 689 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 IRAK2O43187 625 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SPOPO43791 374 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF5CO60282 957 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TLR5O60602 858 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PRAMEF12O95522 483 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT1P04264 644 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CD48P09326 243 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPN2P17706 415 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 NOS2P35228 1153 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 DOC2BQ14184 412 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TCEAL1Q15170 157 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PEX26Q7Z412 305 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 C14orf80Q86SX3 495 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ITIH5Q86UX2 942 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MON1AQ86VX9 555 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM72BQ86X60 149 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ELMOD1Q8N336 334 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF139Q8WU17 664 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MS4A14Q96JA4 679 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MYRFLQ96LU7 910 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CNPY3Q9BT09 278 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TLR10Q9BXR5 811 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 NACA2Q9H009 215 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SIK2Q9H0K1 926 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 S1PR5Q9H228 398 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ASAH2Q9NR71 780 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KCND1Q9NSA2 647 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 STK39Q9UEW8 545 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 AMFRQ9UKV5 643 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CCL26Q9Y258 94 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
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