RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586397.5

PRKAR1A-211, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1A, Length 1,940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-211ENST00000586397 SNX24Q9Y343 169 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 HEY1Q9Y5J3 304 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 CFAP69A5D8W1 941 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 KCNU1A8MYU2 1149 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM72CH0Y354 149 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 SGK1O00141 431 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 TGM5O43548 720 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 CXCL14O95715 111 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 KRT14P02533 472 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 APOEP02649 317 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 RB1P06400 928 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 AMPD1P23109 780 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 PPP3CCP48454 512 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 TUBP50607 506 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 EPHB3P54753 998 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 TBX4P57082 545 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 RING1Q06587 406 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 EFEMP1Q12805 493 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 CALCOCO2Q13137 446 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 MTA1Q13330 715 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 XRCC4Q13426 336 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 TAF12Q16514 161 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 C10orf120Q5SQS8 335 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM72AQ5TYM5 149 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM72DQ6L9T8 149 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ITIH5Q86UX2 942 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM72BQ86X60 149 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 PSMG2Q969U7 264 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 SNF8Q96H20 258 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ABHD8Q96I13 439 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 TLR9Q9NR96 1032 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR12D3Q9UGF7 316 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ASB3Q9Y575 518 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 NR2E3Q9Y5X4 410 aa9.13□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ERICH4A6NGS2 130 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 H7C0C1 242 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 NDC80O14777 642 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 DCLK1O15075 740 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 PAGE1O75459 146 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 LRIG2O94898 1065 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGLV3-27P01718 113 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ITIH2P19823 946 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 STIP1P31948 543 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ATP5OP48047 213 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 GBE1Q04446 702 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 MANEALQ5VSG8 457 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 LILRA6Q6PI73 481 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 HDXQ7Z353 690 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 BBOF1Q8ND07 529 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 POF1BQ8WVV4 589 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 SAMD11Q96NU1 681 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 OLFM3Q96PB7 478 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 FMO2Q99518 471 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 FUT8Q9BYC5 575 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 NEUROG2Q9H2A3 272 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 DTLQ9NZJ0 730 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 RAD54BQ9Y620 910 aa9.12□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 C2orf71A6NGG8 1288 aa9.11□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 HACD1B0YJ81 288 aa9.11□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 MFSD11O43934 449 aa9.11□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 TBX18O95935 607 aa9.11□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 GLUD1P00367 558 aa9.11□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 IFNB1P01574 187 aa9.11□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 IVLP07476 585 aa9.11□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 ERCC2P18074 760 aa9.11□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 IVDP26440 423 aa9.11□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 EPHB2P29323 1055 aa9.11□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 HOXC13P31276 330 aa9.11□□□□□ -0.95
PRKAR1A-211ENST00000586397 SERPINB6P35237 376 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms