RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 CSRP2Q16527 193 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TAF3Q5VWG9 929 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SYPL2Q5VXT5 272 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 RFWD3Q6PCD5 774 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 LPCAT2Q7L5N7 544 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM35BQ8NCS4 154 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
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PTPRM-214ENST00000583153 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CPXM1Q96SM3 734 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 STK33Q9BYT3 514 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 LHX5Q9H2C1 402 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ELOVL2Q9NXB9 296 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 COX16Q9P0S2 106 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO10Q9UK96 956 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC4EQ9ULY5 219 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 RAD54BQ9Y620 910 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 THADAQ6YHU6 1953 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 GFRA2O00451 464 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NPC1O15118 1278 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 IRAK2O43187 625 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 EPN2O95208 641 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CAVIN2O95810 425 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRM-214ENST00000583153 ABCB4P21439 1286 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 BCKDHBP21953 392 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 TGM1P22735 817 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 MPLP40238 635 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 COPB1P53618 953 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NME3Q13232 169 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
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PTPRM-214ENST00000583153 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRM-214ENST00000583153 CHST9Q7L1S5 443 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 BEND5Q7L4P6 421 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRM-214ENST00000583153 TAC4Q86UU9 113 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CHSY1Q86X52 802 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ERICH1Q86X53 443 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 MFN1Q8IWA4 741 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRM-214ENST00000583153 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB106AQ8N104 65 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 CARNMT1Q8N4J0 409 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRM-214ENST00000583153 SPAG5Q96R06 1193 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 GABRG3Q99928 467 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 DDIT4Q9NX09 232 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 STOML2Q9UJZ1 356 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 HCN2Q9UL51 889 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-214ENST00000583153 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.64□□□□□ -1.03
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