RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 ERICH1Q86X53 443 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 HMGB4Q8WW32 186 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 C18orf8Q96DM3 657 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 INVSQ9Y283 1065 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 STON1Q9Y6Q2 735 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 WASH3PC4AMC7 463 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 LRP3O75074 770 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 DAB1O75553 588 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 GBP1P32455 592 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 NOS2P35228 1153 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 SCNN1AP37088 669 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF165P49910 485 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 SPEM2Q0P670 501 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 ENPP2Q13822 863 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 E2F5Q15329 346 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 MS4A13Q5J8X5 152 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM215Q68D42 235 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 C11orf74Q86VG3 221 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 BTN2A3PQ96KV6 586 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 DDIT4Q9NX09 232 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 FAM186AA6NE01 2351 aa22.14■■□□□ 1.14
RNPS1-218ENST00000566180 SLC2A3P11169 496 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 GABRG2P18507 467 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 P2RY2P41231 377 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 NOMO3P69849 1222 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 CDR2Q01850 454 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 ELF2Q15723 593 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA1211LQ6NV74 962 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 XYLT1Q86Y38 959 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 PGBD3Q8N328 593 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 MYEOVQ96EZ4 313 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 CIPCQ9C0C6 399 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 ABCB8Q9NUT2 735 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 GGA2Q9UJY4 613 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 RAD54BQ9Y620 910 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 KCNU1A8MYU2 1149 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 RHOBTB1O94844 696 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 EPN2O95208 641 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 CHRNB2P17787 502 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 CCR1P32246 355 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 MATKP42679 507 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 IL12RB1P42701 662 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 RPS24P62847 133 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 NAA35Q5VZE5 725 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 ADIPOR2Q86V24 386 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 MSANTD4Q8NCY6 345 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 FIBINQ8TAL6 211 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 WFDC5Q8TCV5 224 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 RLN3Q8WXF3 142 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 RRN3Q9NYV6 651 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 STIM2Q9P246 746 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 USP18Q9UMW8 372 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 ABCB4P21439 1286 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 TACR2P21452 398 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 FMO1Q01740 532 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF234Q14588 700 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 IQCB1Q15051 598 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 CSRP2Q16527 193 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 RAP1GAP2Q684P5 730 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 CHST9Q7L1S5 443 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 MFN1Q8IWA4 741 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 AHI1Q8N157 1196 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 SORCS1Q8WY21 1168 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 RNF34Q969K3 372 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 LMLNQ96KR4 655 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 NPY6RQ99463 290 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 COX16Q9P0S2 106 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-218ENST00000566180 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms