RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 GNA15P30679 374 aa22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 SGSHP51688 502 aa22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 RING1Q06587 406 aa22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 WDR45BQ5MNZ6 344 aa22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 CACUL1Q86Y37 369 aa22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 AHI1Q8N157 1196 aa22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 HDDC3Q8N4P3 179 aa22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 ITM2CQ9NQX7 267 aa22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 STIM2Q9P246 746 aa22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 LAMA1P25391 3075 aa22.59■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 MEI4A8MW99 385 aa22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 HLA-EP13747 358 aa22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 PMLP29590 882 aa22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 MPP7Q5T2T1 576 aa22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 PIK3R6Q5UE93 754 aa22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 GBP6Q6ZN66 633 aa22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 ADAM32Q8TC27 787 aa22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 GPR174Q9BXC1 333 aa22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 SUSD2Q9UGT4 822 aa22.58■■□□□ 1.21
CIPC-208ENST00000557115 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 SYPP08247 313 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 CEACAM1P13688 526 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 OXTRP30559 389 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 TPMTP51580 245 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 PLEKHG6Q3KR16 790 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 MBLAC2Q68D91 279 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 GJB7Q6PEY0 223 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 MFN1Q8IWA4 741 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 MLKLQ8NB16 471 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 STK32AQ8WU08 396 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 AZIN2Q96A70 460 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 MED15Q96RN5 788 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 SLC32A1Q9H598 525 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 TLR6Q9Y2C9 796 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa22.57■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 E5RJQ4 531 aa22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 FYNP06241 537 aa22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 SLC9A1P19634 815 aa22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 MAOBP27338 520 aa22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 SLC6A4P31645 630 aa22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 ADIPOR2Q86V24 386 aa22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 DEFB124Q8NES8 71 aa22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 OR2T3Q8NH03 318 aa22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 NUP58Q9BVL2 599 aa22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 CAPN10Q9HC96 672 aa22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 ACP6Q9NPH0 428 aa22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.56■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 ARHGAP33O14559 1287 aa22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 OPHN1O60890 802 aa22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 APOEP02649 317 aa22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 DLDP09622 509 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 CD70P32970 193 aa22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 COPAP53621 1224 aa22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 NNTQ13423 1086 aa22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 MEA1Q16626 185 aa22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 NADSYN1Q6IA69 706 aa22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 FAM124AQ86V42 546 aa22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 CARNMT1Q8N4J0 409 aa22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 ZNF366Q8N895 744 aa22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 TMEM245Q9H330 911 aa22.55■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 KCNJ18B7U540 433 aa22.54■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 CDH18Q13634 790 aa22.54■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.54■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 TAC4Q86UU9 113 aa22.54■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 MINDY1Q8N5J2 469 aa22.54■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 CADM4Q8NFZ8 388 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms