RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 PAEPP09466 180 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 HLA-EP13747 358 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PRKCHP24723 683 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 COPAP53621 1224 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 GRIK2Q13002 908 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 STILQ15468 1287 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 HLA-BQ31612 363 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 MPP7Q5T2T1 576 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 TMEM270Q6UE05 265 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CHST9Q7L1S5 443 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 BHLHA9Q7RTU4 235 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 FAM124AQ86V42 546 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 AHI1Q8N157 1196 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 OR2T3Q8NH03 318 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 IRGQQ8WZA9 623 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SLC35C1Q96A29 364 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 HSFY1Q96LI6 401 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CEP63Q96MT8 703 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CAMK1GQ96NX5 476 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 NT5C1BQ96P26 610 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 LHX5Q9H2C1 402 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 TMEM245Q9H330 911 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 GAREM1Q9H706 876 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 FBRSQ9HAH7 460 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 KLK13Q9UKR3 277 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 NUP205Q92621 2012 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PMM2O15305 246 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 IRAK2O43187 625 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 TBL1XO60907 577 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 FBXO21O94952 628 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CER1O95813 267 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 DLDP09622 509 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ZNF883P0CG24 379 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 C7P10643 843 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 HLA-FP30511 346 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PPP1R2P41236 205 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 MATKP42679 507 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 FMO5P49326 533 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 RGS7P49802 495 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 DAOAP59103 153 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ZBTB16Q05516 673 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 TEAD4Q15561 434 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CCDC40Q4G0X9 1142 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PKDCCQ504Y2 493 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PIK3R6Q5UE93 754 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 MBLAC2Q68D91 279 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PMF1Q6P1K2 205 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ADIPOR2Q86V24 386 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 NAXDQ8IW45 347 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ENGASEQ8NFI3 743 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SPATA20Q8TB22 786 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.49□□□□□ -1.05
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COCH-211ENST00000557065 TFAP2BQ92481 460 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SNX19Q92543 992 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 AZIN2Q96A70 460 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 TIGD1Q96MW7 591 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PRSS16Q9NQE7 514 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 GGA2Q9UJY4 613 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CACNA1EQ15878 2313 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 MYO16Q9Y6X6 1858 aa8.49□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GVT2 93 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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