RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCD1	P33897	745 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP2J2	P51589	502 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CLCNKB	P51801	687 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CASP5	P51878	434 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	GTF2B	Q00403	316 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	GRIK3	Q13003	919 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PNOC	Q13519	176 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	VMAC	Q2NL98	169 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	FIGN	Q5HY92	759 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	LILRA6	Q6PI73	481 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	UNC13D	Q70J99	1090 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	IGSF21	Q96ID5	467 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM9	Q9C026	710 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM206	Q9H813	350 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PLAA	Q9Y263	795 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	COL4A6	Q14031	1691 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF233	A6NK53	670 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SCD	O00767	359 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAPPC3	O43617	180 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	B4GALT3	O60512	393 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SMC2	O95347	1197 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	UROD	P06132	367 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TNNI1	P19237	187 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	GJA4	P35212	333 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	BRCC3	P46736	316 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNQ1	P51787	676 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	GUCY2F	P51841	1108 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF131	P52739	623 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	GYS2	P54840	703 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ITGA1	P56199	1179 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	UBE3A	Q05086	875 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	HYAL1	Q12794	435 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ALCAM	Q13740	583 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CAMK4	Q16566	473 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KYAT1	Q16773	422 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	AAK1	Q2M2I8	961 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	USP41	Q3LFD5	358 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	JADE1	Q6IE81	842 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KY	Q8NBH2	561 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	BEST2	Q8NFU1	509 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SMARCE1	Q969G3	411 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	DPP3	Q9NY33	737 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	THEG	Q9P2T0	379 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	COG5	Q9UP83	839 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61

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