RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	STARD3	Q14849	445 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	AHI1	Q8N157	1196 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	RLN3	Q8WXF3	142 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	LMLN	Q96KR4	655 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TMEM245	Q9H330	911 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TMEM51	Q9NW97	253 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CACNA1E	Q15878	2313 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CAPN9	O14815	690 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	AP5Z1	O43299	807 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	GDF9	O60383	454 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TSPAN3	O60637	253 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	HSF2BP	O75031	334 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	MBD3	O95983	291 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	IGLV3-19	P01714	112 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SLC2A3	P11169	496 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CYP11B1	P15538	503 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	KRT9	P35527	623 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SCNN1A	P37088	669 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	GABRB2	P47870	512 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	FUT11	Q495W5	492 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TAC4	Q86UU9	113 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SYT12	Q8IV01	421 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	PGBD3	Q8N328	593 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TTC17	Q96AE7	1141 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	STK33	Q9BYT3	514 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	GGA2	Q9UJY4	613 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	MAP3K13	O43283	966 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TBL1X	O60907	577 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	APOE	P02649	317 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	PTGER3	P43115	390 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SGSH	P51688	502 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CDK17	Q00537	523 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SLC6A3	Q01959	620 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	ARID5B	Q14865	1188 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	KRT31	Q15323	416 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TAF5	Q15542	800 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CCDC6	Q16204	474 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	PTPRN	Q16849	979 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CHST9	Q7L1S5	443 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	FRMD1	Q8N878	549 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	KDM1B	Q8NB78	822 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	NT5C3B	Q969T7	300 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CIPC	Q9C0C6	399 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	FBRS	Q9HAH7	460 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	ANO10	Q9NW15	660 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	RRN3	Q9NYV6	651 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CEP83	Q9Y592	693 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	RAD54B	Q9Y620	910 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		11.9	□□□□□ -0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms