RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	CEP83	Q9Y592	693 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	RAD54B	Q9Y620	910 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	TBL1X	O60907	577 aa		21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	DAB1	O75553	588 aa		21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	BCKDHB	P21953	392 aa		21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	GABRB2	P47870	512 aa		21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	NOMO3	P69849	1222 aa		21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	XYLT1	Q86Y38	959 aa		21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	SYNC	Q9H7C4	482 aa		21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		21.67	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	TEX33	O43247	280 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ALDH1A2	O94788	518 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	GABRG2	P18507	467 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	IL12RB1	P42701	662 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	CDK17	Q00537	523 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	FMO1	Q01740	532 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	SPEM2	Q0P670	501 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ENPP2	Q13822	863 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	IQCB1	Q15051	598 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	NAA35	Q5VZE5	725 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	FRMD1	Q8N878	549 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	RLN3	Q8WXF3	142 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	LMLN	Q96KR4	655 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	DDIT4	Q9NX09	232 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		21.66	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		21.65	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	SYCE3	A1L190	88 aa		21.65	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		21.65	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ZNF165	P49910	485 aa		21.65	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	CDR2	Q01850	454 aa		21.65	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	MPP7	Q5T2T1	576 aa		21.65	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		21.65	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	21.65	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		21.65	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	COX16	Q9P0S2	106 aa		21.65	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	STIM2	Q9P246	746 aa		21.65	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	21.65	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		21.65	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		21.65	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	LAMA1	P25391	3075 aa		21.64	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	CACNA1A	O00555	2505 aa		21.64	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	APOE	P02649	317 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CD70	P32970	193 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	P2RY2	P41231	377 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	STAT1	P42224	750 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	ZNF234	Q14588	700 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	TRNP1	Q6NT89	227 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	ERICH1	Q86X53	443 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	NEK11	Q8NG66	645 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	C18orf8	Q96DM3	657 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SPAG5	Q96R06	1193 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CIPC	Q9C0C6	399 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	GGA2	Q9UJY4	613 aa		21.64	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	EPN2	O95208	641 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	NDUFV2	P19404	249 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	PRKCH	P24723	683 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	SNX16	P57768	344 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CCDC6	Q16204	474 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CHST9	Q7L1S5	443 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	ZNF677	Q86XU0	584 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	LGI2	Q8N0V4	545 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	LOXL4	Q96JB6	756 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		21.63	■■□□□ 1.05
CS-222	ENST00000550996	NPY6R	Q99463	290 aa		21.63	■■□□□ 1.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms