RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.22□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 IPO13O94829 963 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 SERPINB12Q96P63 405 aa3.22□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 VAMP2P63027 116 aa3.22□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CHRNDQ07001 517 aa3.22□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MERTKQ12866 999 aa3.22□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CUL2Q13617 745 aa3.22□□□□□ -1.89
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