RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 DAB2P98082 770 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 REPS1Q96D71 796 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ACOX2Q99424 681 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ELOVL6Q9H5J4 265 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 DCDC2Q9UHG0 476 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 A0A088AWK7 358 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 YDJCA8MPS7 323 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TPH1P17752 444 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 AMPD1P23109 780 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 OR1D2P34982 312 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PLIN5Q00G26 463 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 HIC1Q14526 733 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ANO5Q75V66 913 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MIER2Q8N344 545 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 USP7Q93009 1102 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GPAMQ9HCL2 828 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GGT7Q9UJ14 662 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TCP11X1B4DZS4 312 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 H0Y3Z8 333 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TIMM44O43615 452 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 NPR3P17342 541 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TYMPP19971 482 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 DENND1BQ6P3S1 775 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 BBS7Q8IWZ6 715 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC126Q96EE4 140 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ARMC7Q9H6L4 198 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RGS18Q9NS28 235 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 OR6C75A6NL08 312 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PFKPQ01813 784 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CSHL1Q14406 222 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CYP51A1Q16850 503 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TUBGCP3Q96CW5 907 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SCOCQ9UIL1 159 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GMNCA6NCL1 334 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RAD51CO43502 376 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 AKAP10O43572 662 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SERPINI2O75830 405 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CLTBP09497 229 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CYP4X1Q8N118 509 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TRPC4Q9UBN4 977 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 V9GYQ6 96 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RAD51BO15315 384 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D4O60343 1298 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 LGR5O75473 907 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GYPCP04921 128 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 UBXN2BQ14CS0 331 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RAB30Q15771 203 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CLEC4FQ8N1N0 589 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ANKS1AQ92625 1134 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TADA1Q96BN2 335 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CDY1Q9Y6F8 540 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 E5RJQ4 531 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PROSCO94903 275 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms