RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 RAP1GAP2Q684P5 730 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 NADSYN1Q6IA69 706 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLFN11Q7Z7L1 901 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CHSY1Q86X52 802 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 NIPA2Q8N8Q9 360 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 BTBD6Q96KE9 485 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 DESI2Q9BSY9 194 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 BBS2Q9BXC9 721 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 RAB6CQ9H0N0 254 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 OSGEPQ9NPF4 335 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 HEBP1Q9NRV9 189 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CA14Q9ULX7 337 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 PIAS3Q9Y6X2 628 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 OBSL1O75147 1896 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 VCANP13611 3396 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 DENND4CQ5VZ89 1909 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 RCCD1A6NED2 376 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 BTNL10A8MVZ5 291 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 F5H5T6 163 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 PJA2O43164 708 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 PROSCO94903 275 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 TYRP14679 529 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 TACR2P21452 398 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 MIPP30301 263 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC6A4P31645 630 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 PCK1P35558 622 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 VCPP55072 806 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SIGLEC14Q08ET2 396 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 AUHQ13825 339 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 MESDQ14696 234 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 BOLA3Q53S33 107 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 EFHC2Q5JST6 749 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 PIK3R6Q5UE93 754 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 RFWD3Q6PCD5 774 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 LRRC31Q6UY01 552 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 TRIM67Q6ZTA4 783 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 LGI2Q8N0V4 545 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SIX5Q8N196 739 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCDC185Q8N715 623 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 NAT16Q8N8M0 369 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 BHMTQ93088 406 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 NTAN1Q96AB6 310 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 OSBPL2Q9H1P3 480 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ANLNQ9NQW6 1124 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 MARK1Q9P0L2 795 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 PCSK1NQ9UHG2 260 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 USP18Q9UMW8 372 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 TFR2Q9UP52 801 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 HS3ST4Q9Y661 456 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 STK25O00506 426 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SRGAP2O75044 1071 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 LRCH4O75427 683 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCDC175P0C221 793 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CTHP32929 405 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 MAN1A1P33908 653 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SSR1P43307 286 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SOX9P48436 509 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 GALK1P51570 392 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 STARD6P59095 220 aa11.62□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 HADHQ16836 314 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 RABGAP1LQ5R372 815 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 MPP7Q5T2T1 576 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ERMARDQ5T6L9 678 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 IER5LQ5T953 404 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 FYB2Q5VWT5 728 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 FBXL22Q6P050 247 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF852Q6ZMS4 543 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 TPRG1Q6ZUI0 275 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CFAP52Q8N1V2 620 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 FAM3CQ92520 227 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 NELL2Q99435 816 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 TSGA10Q9BZW7 698 aa11.62□□□□□ -0.55
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