RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 VDRP11473 427 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 ACSL1P33121 698 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 DAOAP59103 153 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 LHX5Q9H2C1 402 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 MTG2Q9H4K7 406 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM131Q92545 1883 aa25.04■■□□□ 1.6
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PTPRJ-205ENST00000527952 TAF4O00268 1085 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 IGLV3-19P01714 112 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 HLA-BQ31612 363 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 ADGRF1Q5T601 910 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 ISM2Q6H9L7 571 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM270Q6UE05 265 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 SLCO6A1Q86UG4 719 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 ADIPOR2Q86V24 386 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 CLEC4CQ8WTT0 213 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 KAT5Q92993 513 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC35C1Q96A29 364 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 ZSWIM1Q9BR11 485 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM245Q9H330 911 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 ABCC13Q9NSE7 274 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 RMND1Q9NWS8 449 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 GGA2Q9UJY4 613 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 PLA2G4CQ9UP65 541 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
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PTPRJ-205ENST00000527952 CD70P32970 193 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 MATKP42679 507 aa25.03■■□□□ 1.6
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PTPRJ-205ENST00000527952 PKDCCQ504Y2 493 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 MBLAC2Q68D91 279 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 PMF1Q6P1K2 205 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 KCTD13Q8WZ19 329 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 STIM2Q9P246 746 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 CBFA2T3O75081 653 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 BRD2P25440 801 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC6A4P31645 630 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 LAYNQ6UX15 382 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 C1orf216Q8TAB5 229 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 PRSS16Q9NQE7 514 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 CNGB3Q9NQW8 809 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 TM7SF3Q9NS93 570 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 STOML2Q9UJZ1 356 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM221BA6H8Z2 402 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 GOLGA8CPA6NN73 597 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNK3O14649 394 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 SETSIPP0DME0 302 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 RPS14P62263 151 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 RING1Q06587 406 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 E2F5Q15329 346 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 LCLAT1Q6UWP7 414 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 PTPRBP23467 1997 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 M0QYV0 167 aa25■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 CER1O95813 267 aa25■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 FMO5P49326 533 aa25■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 SCAPQ12770 1279 aa25■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 PIK3R6Q5UE93 754 aa25■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 AHI1Q8N157 1196 aa25■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.593e-6■■■■■ 42.5
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PTPRJ-205ENST00000527952 MIS12Q9H081 205 aa25■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 FSBPO95073 299 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 KIF19Q2TAC6 998 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 COBLL1Q53SF7 1204 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 MSANTD2Q6P1R3 559 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 PPM1KQ8N3J5 372 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC35F5Q8WV83 523 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 SMARCE1Q969G3 411 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 NT5C1BQ96P26 610 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 KIAA1257Q9ULG3 409 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 LHX6Q9UPM6 363 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 BTBD3Q9Y2F9 522 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRJ-205ENST00000527952 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
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