RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 BRAFP15056 766 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PHBP35232 272 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ELK3P41970 407 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TSPY1Q01534 308 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PPARDQ03181 441 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SEMA5AQ13591 1074 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PDK1Q15118 436 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM182AQ5T1J6 154 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ARTNQ5T4W7 220 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF534Q76KX8 674 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 CRIPAKQ8N1N5 446 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 DENND1AQ8TEH3 1009 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 HTR3CQ8WXA8 447 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA13Q96N96 652 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 COLEC11Q9BWP8 271 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 KLC2Q9H0B6 622 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 OSBPL2Q9H1P3 480 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PLAC1Q9HBJ0 212 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 RSPH14Q9UHP6 348 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM43BA6NCK2 446 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 EBAG9O00559 213 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SYN3O14994 580 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SPAG6O75602 509 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 GSTA2P09210 222 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ERCC2P18074 760 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 FDFT1P37268 417 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TLE2Q04725 743 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 WASHC5Q12768 1159 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 BFSP2Q13515 415 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 QPCTQ16769 361 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TCTN1Q2MV58 587 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 FAXCQ5TGI0 409 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 C6orf89Q6UWU4 347 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SCD5Q86SK9 330 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TAC4Q86UU9 113 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PALM2Q8IXS6 379 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 DBF4BQ8NFT6 615 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAM32Q8TC27 787 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 FBF1Q8TES7 1133 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 MZB1Q8WU39 189 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 MYLIPQ8WY64 445 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 EDEM1Q92611 657 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC39Q96DD0 335 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SIGLEC10Q96LC7 697 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 CASD1Q96PB1 797 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM62Q9BVG3 475 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PRDM12Q9H4Q4 367 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 DDIT4Q9NX09 232 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 IL37Q9NZH6 218 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 COX16Q9P0S2 106 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TBK1Q9UHD2 729 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 NLRC5Q86WI3 1866 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.635e-6■■■■□ 19.4
SH3BP2-209ENST00000504450 CREB3O43889 395 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 AVILO75366 819 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM155BO75949 473 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 MLNP12872 115 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 CYP2C18P33260 490 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 24.7
SH3BP2-209ENST00000504450 TMED2Q15363 201 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 ARL13BQ3SXY8 428 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 TP53INP2Q8IXH6 220 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 VPS52Q8N1B4 723 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 SCAMP5Q8TAC9 235 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 CKAP2Q8WWK9 683 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP2-209ENST00000504450 P2RY11Q96G91 374 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms