RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 WDR24Q96S15 920 aa5.43□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 VPS45Q9NRW7 570 aa5.43□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 RXFP3Q9NSD7 469 aa5.43□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 DEPDC5O75140 1603 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 PMM2O15305 246 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 KCNQ3O43525 872 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 PRAMEF2O60811 474 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 KRT18P05783 430 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 MST1P26927 711 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 SLC5A9Q2M3M2 681 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 P3H1Q32P28 736 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 BCAS4Q8TDM0 211 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 BRI3BPQ8WY22 251 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 TBCBQ99426 244 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 SENP7Q9BQF6 1050 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 TRIM2Q9C040 744 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 PCDHAC1Q9H158 963 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 MTMR4Q9NYA4 1195 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 MED14O60244 1454 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 SHANK2Q9UPX8 1470 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 UGGT1Q9NYU2 1555 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 MYOM3Q5VTT5 1437 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa5.41□□□□□ -1.54
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RBM39-241ENST00000496183 ARP10275 920 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 EGR1P18146 543 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 PBX1P40424 430 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 NR4A2P43354 598 aa5.41□□□□□ -1.54
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RBM39-241ENST00000496183 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 MTAPQ13126 283 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 PICALMQ13492 652 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 ATP1A4Q13733 1029 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 KSR2Q6VAB6 950 aa5.41□□□□□ -1.54
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RBM39-241ENST00000496183 RNF152Q8N8N0 203 aa5.41□□□□□ -1.54
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RBM39-241ENST00000496183 TRMOQ9BU70 441 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 POT1Q9NUX5 634 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 CA14Q9ULX7 337 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 VPS4AQ9UN37 437 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 DUOX2Q9NRD8 1548 aa5.41□□□□□ -1.54
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RBM39-241ENST00000496183 ERBINQ96RT1 1412 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 TTC3P53804 2025 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 TLR2O60603 784 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 PLAUP00749 431 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 CTSAP10619 480 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 VPS41P49754 854 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 CFHR1Q03591 330 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.4□□□□□ -1.54
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RBM39-241ENST00000496183 ZNF793Q6ZN11 406 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 KRT27Q7Z3Y8 459 aa5.4□□□□□ -1.54
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RBM39-241ENST00000496183 ZNF566Q969W8 418 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 KAZALD1Q96I82 304 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 FCRL5Q96RD9 977 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.4□□□□□ -1.547e-8■□□□□ 8.8
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RBM39-241ENST00000496183 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-241ENST00000496183 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa5.4□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ABCC3O15438 1527 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 NEURL4Q96JN8 1562 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 A0A087WZ62 844 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 PROB1E7EW31 1015 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 F8W810 466 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ADAM10O14672 748 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 MYL1P05976 194 aa5.39□□□□□ -1.55
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