RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 C6orf89Q6UWU4 347 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CXCL17Q6UXB2 119 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 BBS12Q6ZW61 710 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TTC30AQ86WT1 665 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa7.27□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 A8MXQ7 604 aa7.27□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 STX2P32856 288 aa7.27□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 SIGLEC14Q08ET2 396 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 KRT81Q14533 505 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.252e-6■□□□□ 10.5
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HERC4-211ENST00000492996 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.27□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 CENPUQ71F23 418 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CENPTQ96BT3 561 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 CD207Q9UJ71 328 aa7.27□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 MORF4L2Q15014 288 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CA9Q16790 459 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SLC5A9Q2M3M2 681 aa7.26□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 SLC27A1Q6PCB7 646 aa7.26□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 SPATA21Q7Z572 469 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PYROXD1Q8WU10 500 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 FAM172AQ8WUF8 416 aa7.26□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa7.26□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.26□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 F5H423 210 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA8RI6L899 631 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TREHO43280 583 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TMEM63AO94886 807 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 MYL3P08590 195 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CTSAP10619 480 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 MAGEA8P43361 318 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 UBXN11Q5T124 520 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 WLSQ5T9L3 541 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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