RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 KCNA4P22459 653 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 GLRBP48167 497 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 SERPINB10P48595 397 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 PARP6Q2NL67 630 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 TBL1YQ9BQ87 522 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 SMPD4Q9NXE4 827 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 DTNAQ9Y4J8 743 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 NR2E3Q9Y5X4 410 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 ATP9AO75110 1047 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 ERBB2P04626 1255 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 NUDT2P50583 147 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 NCALDP61601 193 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 DUSP28Q4G0W2 176 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 LRRC49Q8IUZ0 686 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD52Q8NB46 1076 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 SH3GL1Q99961 368 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 DGKIO75912 1065 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 PGK1P00558 417 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 MTMR14Q8NCE2 650 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 SHC3Q92529 594 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 NDEL1Q9GZM8 345 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 SUFUQ9UMX1 484 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 BTKQ06187 659 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 OVGP1Q12889 678 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 ZACNQ401N2 412 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 C16orf87Q6PH81 154 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 LAYNQ6UX15 382 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 KAT2BQ92831 832 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 SEMA4AQ9H3S1 761 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 IL1RL2Q9HB29 575 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 NMRAL1Q9HBL8 299 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 TAS2R13Q9NYV9 303 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 F8W810 466 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 TSPAN3O60637 253 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 CYP2A7P20853 494 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 BCL2L1Q07817 233 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 KLC1Q07866 573 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 WLSQ5T9L3 541 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 ZNF662Q6ZS27 426 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 TEX9Q8N6V9 391 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 TMED1Q13445 227 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 CASP10Q92851 521 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 OTULINQ96BN8 352 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 ABHD8Q96I13 439 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 MAMLD1Q13495 774 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 PHKG1Q16816 387 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 TMC3Q7Z5M5 1100 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 DNAAF5Q86Y56 855 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 PHACTR4Q8IZ21 702 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 DNAJC18Q9H819 358 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 GLTPD2A6NH11 291 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 MLNP12872 115 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 WEE1P30291 646 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 MMP13P45452 471 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 FUT2Q10981 343 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 DNPEPQ9ULA0 475 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 KRT6AP02538 564 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 KRT6BP04259 564 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 RPL21P46778 160 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 KRT6CP48668 564 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 CYTH1Q15438 398 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 HECTD3Q5T447 861 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 GRAMD4Q6IC98 578 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 ADAM32Q8TC27 787 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 DNAJC9Q8WXX5 260 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 ELOVL6Q9H5J4 265 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 GDF3Q9NR23 364 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 SPG21Q9NZD8 308 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 PCDH8O95206 1070 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 CSH1P0DML2 217 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 CSH2P0DML3 217 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 EPB42P16452 691 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 GRIK3Q13003 919 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 SGCGQ13326 291 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-213ENST00000489895 IL17AQ16552 155 aa17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms