RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474820.5

RBMS1-209, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 1 (best)

Gene RBMS1, Length 4,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-209	ENST00000474820	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	LRRD1	A4D1F6	860 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	FLT3LG	P49771	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	CPT1A	P50416	773 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	TMEM135	Q86UB9	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	BTBD6	Q96KE9	485 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62	7e-6	■■■■□ 21.6
RBMS1-209	ENST00000474820	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	EML5	Q05BV3	1969 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	OBSL1	O75147	1896 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	SGK1	O00141	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	AP1G1	O43747	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	UBOX5	O94941	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	INSRR	P14616	1297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	SERPINB6	P35237	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	TNFSF9	P41273	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	FAM228A	Q86W67	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	CYP4X1	Q8N118	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	MATN2	O00339	956 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	DCLK1	O15075	740 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	MT-ND3	P03897	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	MARK3	P27448	753 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	TAF6	P49848	677 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	ATP4B	P51164	291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	SCNN1G	P51170	649 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	DNAJB13	P59910	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	GRIK4	Q16099	956 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-209	ENST00000474820	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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