RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 DDIT4Q9NX09 232 aa9.5□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 COX16Q9P0S2 106 aa9.5□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.5□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 STIM2Q9P246 746 aa9.5□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.5□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.5□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PQC6 194 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 WASH3PC4AMC7 463 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 GOLGA8SH3BPF8 625 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 TIMM44O43615 452 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 RPP40O75818 363 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 ALDH1A2O94788 518 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 CCDC172P0C7W6 258 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 SLC2A3P11169 496 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 FERP16591 822 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 ABCB4P21439 1286 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 TACR2P21452 398 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 MMP8P22894 467 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 HLA-FP30511 346 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 SCNN1AP37088 669 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 RPS24P62847 133 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 FANCCQ00597 558 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 NME3Q13232 169 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 RAP1GAP2Q684P5 730 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 TMEM215Q68D42 235 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 ANO7Q6IWH7 933 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 TRIM72Q6ZMU5 477 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 CEP68Q76N32 757 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 RASSF3Q86WH2 238 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 CFAP52Q8N1V2 620 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 DCLK2Q8N568 766 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 UCMAQ8WVF2 138 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 BAP1Q92560 729 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 RUBCNQ92622 972 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 NT5C3BQ969T7 300 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 NPY6RQ99463 290 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 GABRG3Q99928 467 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 AGPAT1Q99943 283 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 ELOVL2Q9NXB9 296 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 RRN3Q9NYV6 651 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 TMEM59LQ9UK28 342 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 RAB23Q9ULC3 237 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 STAP1Q9ULZ2 295 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 MYO6Q9UM54 1294 aa9.49□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PQF6 199 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 LRRC53A6NM62 1247 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 F9P00740 461 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 HOXB2P14652 356 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 FLT3P36888 993 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 IL12RB1P42701 662 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 SULT1E1P49888 294 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 UBASH3AP57075 661 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 DEUP1Q05D60 604 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 PTP4A2Q12974 167 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A52Q3SY17 297 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 RNF43Q68DV7 783 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 TRNP1Q6NT89 227 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 CHST9Q7L1S5 443 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 ARCQ7LC44 396 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 ADIPOR2Q86V24 386 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 CHSY1Q86X52 802 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 MFN1Q8IWA4 741 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 LGI2Q8N0V4 545 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 PGBD3Q8N328 593 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 FIBINQ8TAL6 211 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 SORCS1Q8WY21 1168 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 TBCBQ99426 244 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 HINFPQ9BQA5 517 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 C11orf70Q9BRQ4 267 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 CIPCQ9C0C6 399 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 WDCPQ9H6R7 721 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 PIGVQ9NUD9 493 aa9.48□□□□□ -0.89
SYN3-211ENST00000472027 ABCB8Q9NUT2 735 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms