RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 LCA5LO95447 670 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 LMNAP02545 664 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM253P0C7T8 217 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 SP9P0CG40 484 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 GLULP15104 373 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ARSAP15289 507 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 CHKAP35790 457 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 FOXK2Q01167 660 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP2R5DQ14738 602 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC14Q49A88 953 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM68Q6AZZ1 485 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 STRADAQ7RTN6 431 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 BNIPLQ7Z465 357 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 FNIP1Q8TF40 1166 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 CNPY3Q9BT09 278 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ECT2Q9H8V3 914 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 COX16Q9P0S2 106 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 RDXP35241 583 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 CXCR3P49682 368 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP11AP98196 1134 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 AMPD2Q01433 879 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 TNK2Q07912 1038 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 BRMS1LQ5PSV4 323 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 CPXM2Q8N436 756 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 MSANTD3Q96H12 275 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNF1Q9H3M0 494 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 WDCPQ9H6R7 721 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 STOML2Q9UJZ1 356 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 SOWAHDA6NJG2 315 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNU1A8MYU2 1149 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ACSL4O60488 711 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFA10O95299 355 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ADH1CP00326 375 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 MAGEA1P43355 309 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 DHCR24Q15392 516 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ADGRF1Q5T601 910 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf228Q6PIY5 440 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM217AQ8IXS0 508 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 BTN2A3PQ96KV6 586 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 NELL2Q99435 816 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 NUP85Q9BW27 656 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 LTB4R2Q9NPC1 389 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 SPHK2Q9NRA0 654 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 PIGVQ9NUD9 493 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 GTSE1Q9NYZ3 720 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 UVRAGQ9P2Y5 699 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 R4GN57 208 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 PSMA2P25787 234 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 GAD2Q05329 585 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 CDO1Q16878 200 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF528Q3MIS6 628 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 RHBDF2Q6PJF5 856 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM139Q8IV31 216 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC112Q8NEF3 446 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM172AQ8WUF8 416 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGEF26Q96DR7 871 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 NCAPGQ9BPX3 1015 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 PACSIN1Q9BY11 444 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ADAM33Q9BZ11 813 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 HEBP1Q9NRV9 189 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXO4Q9UKT5 387 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 PYCARDQ9ULZ3 195 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 COL4A3Q01955 1670 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 MAN2B1O00754 1011 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 CCP110O43303 1012 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 NRDCO43847 1150 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP17A1P05093 508 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 UBXN2BQ14CS0 331 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 ACAP1Q15027 740 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 LY6G5CQ5SRR4 150 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 RAD9BQ6WBX8 426 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-205ENST00000450873 TTC8Q8TAM2 541 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms