RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	NPC1	O15118	1278 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	LAMTOR5	O43504	91 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	MFAP3L	O75121	409 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PDGFRA	P16234	1089 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	COL9A1	P20849	921 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	HOXA6	P31267	233 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	DGKG	P49619	791 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SULT1E1	P49888	294 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	DEUP1	Q05D60	604 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	MTAP	Q13126	283 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	C2CD6	Q53TS8	623 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	STRADA	Q7RTN6	431 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	WDCP	Q9H6R7	721 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PIGV	Q9NUD9	493 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241		K7EQS6	105 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CISD3	P0C7P0	127 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SKIL	P12757	684 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SLC6A11	P48066	632 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	NME3	Q13232	169 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ANGPT1	Q15389	498 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	USP33	Q8TEY7	942 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf74	Q96LT6	269 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	HAPLN3	Q96S86	360 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TBCB	Q99426	244 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241		F5H5T6	163 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TIMM44	O43615	452 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RNF40	O75150	1001 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TACR2	P21452	398 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	GPD1	P21695	349 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RRM1	P23921	792 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SLC6A4	P31645	630 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CXCL12	P48061	93 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	AIF1	P55008	147 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	GAS6	Q14393	721 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC14	Q49A88	953 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	C5orf22	Q49AR2	442 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TRNP1	Q6NT89	227 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	WDR59	Q6PJI9	974 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SYT13	Q7L8C5	426 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	NAT16	Q8N8M0	369 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS33	Q8NF86	280 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241	AP5Z1	O43299	807 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF75D	P51815	510 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241	NRL	P54845	237 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241	OXCT1	P55809	520 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241	KDSR	Q06136	332 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241	TCF15	Q12870	199 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241	MAMLD1	Q13495	774 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241	SLC18A3	Q16572	532 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZS52	159 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
PTPA-222	ENST00000445241	CHSY1	Q86X52	802 aa		15.14	■□□□□ 0.01

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