RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GFRA2O00451 464 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EPHB6O15197 1021 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TEX33O43247 280 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ACSL4O60488 711 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LILRB5O75023 590 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GFPT2O94808 682 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 F9P00740 461 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGLV3-25P01717 112 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CISD3P0C7P0 127 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TDGF1P13385 188 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FERP16591 822 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCR1P32246 355 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MATKP42679 507 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DGKGP49619 791 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KLK7P49862 253 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NOMO3P69849 1222 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SATB1Q01826 763 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PTPN20Q4JDL3 420 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DCAF6Q58WW2 860 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FIGNQ5HY92 759 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EOGTQ5NDL2 527 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TAF3Q5VWG9 929 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FYB2Q5VWT5 728 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SYPL2Q5VXT5 272 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 Q6ZS52 159 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LONP2Q86WA8 852 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PASD1Q8IV76 773 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DEFB106AQ8N104 65 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NAT16Q8N8M0 369 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TERB1Q8NA31 727 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DDI1Q8WTU0 396 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EBF1Q9UH73 591 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DAB1O75553 588 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 APOEP02649 317 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ERBB2P04626 1255 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MMEP08473 750 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 JUNDP17535 347 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CHRNB2P17787 502 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MMP8P22894 467 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MRE11P49959 708 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DGKEP52429 567 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UBASH3AP57075 661 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FANCCQ00597 558 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FMO1Q01740 532 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DMC1Q14565 340 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TAF5Q15542 800 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C2orf27AQ580R0 203 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SDE2Q6IQ49 451 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TAC4Q86UU9 113 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LUZP1Q86V48 1076 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C12orf40Q86WS4 652 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UCMAQ8WVF2 138 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NT5C3BQ969T7 300 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALDH1A2O94788 518 aa8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 APBB3O95704 486 aa8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TPM3P06753 285 aa8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ABCB4P21439 1286 aa8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NTSR1P30989 418 aa8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GUCA2AQ02747 115 aa8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NFKBIBQ15653 356 aa8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CRY1Q16526 586 aa8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.44□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms