RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 VCXQ9H320 206 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 CAB39LQ9H9S4 337 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC39A10Q9ULF5 831 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 GYG2O15488 501 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 CFLARO15519 480 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 DNAJC6O75061 913 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SERPINB3P29508 390 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 NOMO1Q15155 1222 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM110CQ1W6H9 321 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 PPM1JQ5JR12 505 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 RHBDF2Q6PJF5 856 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 TNS4Q8IZW8 715 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ZIC5Q96T25 663 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 PHIPQ8WWQ0 1821 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 C9IYK1 514 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 GJA9P57773 515 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 POU5F2Q8N7G0 328 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 OR6P1Q8NGX9 317 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 MCRS1Q96EZ8 462 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 MPP6Q9NZW5 540 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 RABGEF1Q9UJ41 708 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 NRP1O14786 923 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 CXCR3P49682 368 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC12A2P55011 1212 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 STILQ15468 1287 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ECHDC2Q86YB7 292 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC43Q8N309 656 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 NOD2Q9HC29 1040 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 BFARQ9NZS9 450 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 GOLGA8OA6NCC3 632 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 GOLGA8NF8WBI6 632 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 TSPAN3O60637 253 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 NPR3P17342 541 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ERCC2P18074 760 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 PDK2Q15119 407 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 DDR2Q16832 855 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 RINLQ6ZS11 566 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 OTOAQ7RTW8 1153 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 FSD1LQ9BXM9 530 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 CCL22O00626 93 aa13.96□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 TRPA1O75762 1119 aa13.96□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 DGKIO75912 1065 aa13.96□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 TSPY1Q01534 308 aa13.96□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 NR1H3Q13133 447 aa13.96□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 KYAT1Q16773 422 aa13.96□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 OLFML1Q6UWY5 402 aa13.96□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM105AQ9NUU6 356 aa13.96□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 PDHA1P08559 390 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 PROZP22891 400 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 MIEF2Q96C03 454 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 P2RY11Q96G91 374 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 PCED1BQ96HM7 432 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 MS4A4AQ96JQ5 239 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF358Q9NW07 568 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 MEI4A8MW99 385 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 KRT16P08779 473 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 HIC1Q14526 733 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 MGAT5BQ3V5L5 792 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC26A11Q86WA9 606 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 CRLF3Q8IUI8 442 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 SHCBP1Q8NEM2 672 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM161BQ96MY7 647 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 KIAA1257Q9ULG3 409 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 MAXP61244 160 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 EFEMP1Q12805 493 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 CRHR2Q13324 411 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 UNC5AQ6ZN44 842 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 PQLC3Q8N755 202 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 CCT6BQ92526 530 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM209Q96SK2 561 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa13.95□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM72CH0Y354 149 aa13.94□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 TADA2AO75478 443 aa13.94□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 TGM2P21980 687 aa13.94□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 SERPINB4P48594 390 aa13.94□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 CERCAMQ5T4B2 595 aa13.94□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM72AQ5TYM5 149 aa13.94□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM72DQ6L9T8 149 aa13.94□□□□□ -0.18
RABGEF1-210ENST00000437078 ISLR2Q6UXK2 745 aa13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms