RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	BAP1	Q92560	729 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ANKRD62	A6NC57	917 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160		F5H5T6	163 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	AXIN1	O15169	862 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	EPHB6	O15197	1021 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ENDOD1	O94919	500 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CHST9	Q7L1S5	443 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	MOCS3	O95396	460 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TACR2	P21452	398 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	PBX1	P40424	430 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	PTPN9	P43378	593 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CXCR3	P49682	368 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	UBASH3A	P57075	661 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	BNIPL	Q7Z465	357 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	C1orf74	Q96LT6	269 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	DDIT4	Q9NX09	232 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	GFRA3	O60609	400 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	RHOBTB1	O94844	696 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	MYBL1	P10243	752 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SULT1E1	P49888	294 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	AIF1	P55008	147 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	DRC7	Q8IY82	874 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NAT16	Q8N8M0	369 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	C3orf20	Q8ND61	904 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SPACA7	Q96KW9	195 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TEX33	O43247	280 aa		11.4	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	GZMA	P12544	262 aa		11.4	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	FNTB	P49356	437 aa		11.4	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	SEC13	P55735	322 aa		11.4	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	CRY1	Q16526	586 aa		11.4	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	STRADA	Q7RTN6	431 aa		11.4	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	VPS36	Q86VN1	386 aa		11.4	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	RNF34	Q969K3	372 aa		11.4	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	HAPLN3	Q96S86	360 aa		11.4	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	GGA2	Q9UJY4	613 aa		11.4	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	TBL1X	O60907	577 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	TIE1	P35590	1138 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	DEUP1	Q05D60	604 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	SULT2A1	Q06520	285 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	LUZP1	Q86V48	1076 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	CHSY1	Q86X52	802 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	TTC17	Q96AE7	1141 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	SYT11	Q9BT88	431 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	C5orf42	Q9H799	3197 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160		M0QYT0	321 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	PLK1	P53350	603 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	ZBED6	P86452	979 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	ARID5A	Q03989	594 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	PTP4A2	Q12974	167 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	STARD3	Q14849	445 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	MON1B	Q7L1V2	547 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	ALLC	Q8N6M5	410 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		11.39	□□□□□ -0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms