RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM176AQ96HP8 235 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 POMPQ9Y244 141 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ANK1P16157 1881 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 B4GALT4O60513 344 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SIN3BO75182 1162 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CILPO75339 1184 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ICAM3P32942 547 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 GRIA1P42261 906 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM132AQ24JP5 1023 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 OR6B2Q6IFH4 312 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 MPZL3Q6UWV2 235 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM50Q86XT4 487 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 UNC5BQ8IZJ1 945 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CHST13Q8NET6 341 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDH19Q8TAB3 1148 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 RTP4Q96DX8 246 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATC1LQ9H0A9 340 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP4F11Q9HBI6 524 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC17A6Q9P2U8 582 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 H3BNX3 289 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 APOL1O14791 398 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TMCC1O94876 653 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 METTL18O95568 372 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ITGB3P05106 788 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM200BP0CF97 657 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 EPHX2P34913 555 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CA9Q16790 459 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 GRAMD1BQ3KR37 738 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 C16orf46Q6P387 395 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TMC7Q7Z402 723 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 GSDMBQ8TAX9 411 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SIGLEC10Q96LC7 697 aa18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 GSRP00390 522 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PROZP22891 400 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TLR1Q15399 786 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ATF7IP2Q5U623 682 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 MBLAC2Q68D91 279 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 HPS6Q86YV9 775 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 RIOX2Q8IUF8 465 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 NLRP4Q96MN2 994 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 GCNAQ96QF7 691 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TXNRD2Q9NNW7 524 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SOWAHBA6NEL2 793 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM159BA6NKW6 160 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CNMDO75829 334 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ITGAXP20702 1163 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 YY1P25490 414 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL5P46777 297 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC1A6P48664 564 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SNAPC2Q13487 334 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM259Q4ZIN3 620 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 EEPD1Q7L9B9 569 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 MAVSQ7Z434 540 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ERO1BQ86YB8 467 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DEFB107AQ8IZN7 70 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 MARVELD2Q8N4S9 558 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 EFCAB3Q8N7B9 438 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPRHQ9HD43 1115 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DTNAQ9Y4J8 743 aa18.86■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CAPN8A6NHC0 703 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TFAP2AP05549 437 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP3A5P20815 502 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 FDFT1P37268 417 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGEA3P43357 314 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 IER5Q5VY09 327 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 KBTBD6Q86V97 674 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP7D3Q8IWC1 876 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXW8Q8N3Y1 598 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL23Q8NBE8 558 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms