RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 R3HDM4Q96D70 268 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 MCRS1Q96EZ8 462 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 FSD1LQ9BXM9 530 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 KCNK9Q9NPC2 374 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 WASH6PQ9NQA3 447 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 VPS45Q9NRW7 570 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 RASSF1Q9NS23 344 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 NDUFAF4Q9P032 175 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 GABRQQ9UN88 632 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 E7EVH7 732 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 J3KRW8 73 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 PSMD9O00233 223 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 SPRY2O43597 315 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 PMPCBO75439 489 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 LARGE1O95461 756 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 LATS1O95835 1130 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 DRD1P21728 446 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 KELP23276 732 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 MPGP29372 298 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 SERPINA4P29622 427 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 GKP32189 559 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 MCM5P33992 734 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 GSTM5P46439 218 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 DGKQP52824 942 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 TLE2Q04725 743 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 RPS6KA2Q15349 733 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 CYP1B1Q16678 543 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 TBC1D25Q3MII6 688 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 GALNTL6Q49A17 601 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF626Q68DY1 528 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 CLEC4GQ6UXB4 293 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF66Q6ZN08 573 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 RINLQ6ZS11 566 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 Q6ZWC4 215 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 NEK8Q86SG6 692 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 HMGB4Q8WW32 186 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 COG8Q96MW5 612 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 TWNKQ96RR1 684 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 PRR25Q96S07 402 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 MECRQ9BV79 373 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 BRD8Q9H0E9 1235 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 SLC13A4Q9UKG4 626 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 SLC38A8A6NNN8 435 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 M0QZQ0 153 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 PPP6CO00743 305 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 KRT38O76015 456 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 TJP3O95049 919 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 TFRCP02786 760 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 TUBB4AP04350 444 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CYP21A2P08686 494 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CNPP09543 421 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CYP2D6P10635 497 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 RXRAP19793 462 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CTGFP29279 349 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 MCM2P49736 904 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CCR5P51681 352 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CYP4F2P78329 520 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 E2F1Q01094 437 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 UBE3AQ05086 875 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 DEUP1Q05D60 604 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 SEMA3BQ13214 749 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 P3H1Q32P28 736 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 WDR78Q5VTH9 848 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 MORN5Q5VZ52 161 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF425Q6IV72 752 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 RETSATQ6NUM9 610 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 MTHFD1LQ6UB35 978 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 TRIM72Q6ZMU5 477 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 BBS12Q6ZW61 710 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 SYT13Q7L8C5 426 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 NME8Q8N427 588 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 ESX1Q8N693 406 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms