RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414963.2

SF3B1-204, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B1, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-204ENST00000414963 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 MANEALQ5VSG8 457 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 Q6ZNB5 142 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 RNF157Q96PX1 679 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 TDP1Q9NUW8 608 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 OBSL1O75147 1896 aa14.75□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CDH23Q9H251 3354 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 E2F8A0AVK6 867 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 FAM72CH0Y354 149 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 H3BRJ5 948 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ACSL4O60488 711 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 HMBSP08397 361 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 HOXC13P31276 330 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ARL4AP40617 200 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 C5orf22Q49AR2 442 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 FAM72AQ5TYM5 149 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 FAM72DQ6L9T8 149 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 AADACL2Q6P093 401 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 FAM72BQ86X60 149 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 FAM217AQ8IXS0 508 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 MYLIPQ8WY64 445 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 SUSD6Q92537 303 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 FGF13Q92913 245 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 WBP2Q969T9 261 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 MS4A14Q96JA4 679 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 GUCD1Q96NT3 240 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 EPAS1Q99814 870 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 APOL5Q9BWW9 433 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CALN1Q9BXU9 219 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 DRGXA6NNA5 263 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 LEFTY2O00292 366 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 GFRA2O00451 464 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 LRIG2O94898 1065 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 TJP3O95049 919 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 FGGP02679 453 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 PAFAH1B1P43034 410 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 MMRN1Q13201 1228 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 DPYSQ14117 519 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 TFDP2Q14188 446 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ADGRF1Q5T601 910 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 RFX8Q6ZV50 586 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 BBS12Q6ZW61 710 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 Q7L0L9 218 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 DENND1CQ8IV53 801 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 DEFB123Q8N688 67 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ING5Q8WYH8 240 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 SIK2Q9H0K1 926 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CD207Q9UJ71 328 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CDH7Q9ULB5 785 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms