RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 HARS2P49590 506 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 SGSHP51688 502 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 GAD2Q05329 585 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 NME3Q13232 169 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 GAS6Q14393 721 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 PKN3Q6P5Z2 889 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 RFWD3Q6PCD5 774 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 BEND5Q7L4P6 421 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 DTWD2Q8NBA8 298 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 PRSS33Q8NF86 280 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 JOSD2Q8TAC2 188 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 SLC39A13Q96H72 371 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 SERPINB11Q96P15 392 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 BBS2Q9BXC9 721 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 OSBPL6Q9BZF3 934 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 DCLK3Q9C098 648 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 C2orf42Q9NWW7 574 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 DDIT4Q9NX09 232 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 TMEM59LQ9UK28 342 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 CLEC4EQ9ULY5 219 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 TLR6Q9Y2C9 796 aa13.03□□□□□ -0.32
CNMD-201ENST00000377962 RCCD1A6NED2 376 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 M0QYT0 321 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 IRAK2O43187 625 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 TYRP14679 529 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 NOS2P35228 1153 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 MATKP42679 507 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 SEC13P55735 322 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 MTAPQ13126 283 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 CCINQ13939 588 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 DCUN1D2Q6PH85 259 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 KIAA1328Q86T90 577 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 SLC39A7Q92504 469 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 MSANTD3Q96H12 275 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 CFAP57Q96MR6 1250 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 TBCBQ99426 244 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 NPY6RQ99463 290 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 TRIM62Q9BVG3 475 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 PIGVQ9NUD9 493 aa13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 K7EQS6 105 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 TULP3O75386 442 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 SULT1E1P49888 294 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 VAV2P52735 878 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 AMPD2Q01433 879 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 RING1Q06587 406 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 ADGRF1Q5T601 910 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 EMC10Q5UCC4 262 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 FYB2Q5VWT5 728 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 ARCQ7LC44 396 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 FAM217AQ8IXS0 508 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 PHTF2Q8N3S3 785 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 SLC35G2Q8TBE7 412 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 RXFP2Q8WXD0 754 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 MCEEQ96PE7 176 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 NUP85Q9BW27 656 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 LACRTQ9GZZ8 138 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 ANLNQ9NQW6 1124 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 MARK1Q9P0L2 795 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 METRNQ9UJH8 293 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 ZNF510Q9Y2H8 683 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 SCINQ9Y6U3 715 aa13.01□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 A0A0U1RQJ8 604 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 TMEM191CA6NGB0 347 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 C2CD4BA6NLJ0 364 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 GFRA2O00451 464 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 NCAM2O15394 837 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 PJA2O43164 708 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 ACSL4O60488 711 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 RNF40O75150 1001 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 KAT7O95251 611 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 PENKP01210 267 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 CCDC175P0C221 793 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 PDGFRAP16234 1089 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 CHKAP35790 457 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 GGCXP38435 758 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 RPS9P46781 194 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 ATP11AP98196 1134 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 TCF15Q12870 199 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 NUGGCQ68CJ6 796 aa13□□□□□ -0.33
CNMD-201ENST00000377962 C1orf228Q6PIY5 440 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms