RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 DDI1Q8WTU0 396 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD4-201ENST00000306324 SHDQ96IW2 340 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD4-201ENST00000306324 SIK2Q9H0K1 926 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD4-201ENST00000306324 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD4-201ENST00000306324 OSGEPQ9NPF4 335 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD4-201ENST00000306324 ANLNQ9NQW6 1124 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD4-201ENST00000306324 PLK2Q9NYY3 685 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD4-201ENST00000306324 TFR2Q9UP52 801 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD4-201ENST00000306324 ATG2BQ96BY7 2078 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXD4-201ENST00000306324 MYO1FO00160 1098 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 STK25O00506 426 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 TYRP14679 529 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 GLULP15104 373 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 GGCXP38435 758 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MTA1Q13330 715 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 ARL13BQ3SXY8 428 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MS4A13Q5J8X5 152 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PIK3R6Q5UE93 754 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 RHOT2Q8IXI1 618 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 NAT16Q8N8M0 369 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 RFFLQ8WZ73 363 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MFSD1Q9H3U5 465 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 IP6K2Q9UHH9 426 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 I6L893 689 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 TACR2P21452 398 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MPPE1Q53F39 396 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 TXNDC11Q6PKC3 985 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 LGI2Q8N0V4 545 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC185Q8N715 623 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 CHFRQ96EP1 664 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MSANTD3Q96H12 275 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 DESI2Q9BSY9 194 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MARK1Q9P0L2 795 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 HS3ST4Q9Y661 456 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 DOCK4Q8N1I0 1966 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM221A6NGB7 291 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 F5H5T6 163 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 M0R296 226 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MAN2B1O00754 1011 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 NRDCO43847 1150 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 KRT83P78385 493 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 GAB4Q2WGN9 574 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 FYB2Q5VWT5 728 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF852Q6ZMS4 543 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 FAM3CQ92520 227 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP6O43182 974 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 ADRA1BP35368 520 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 SGSHP51688 502 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 STARD6P59095 220 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 ACAP1Q15027 740 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PON2Q15165 354 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 SLFN11Q7Z7L1 901 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA1328Q86T90 577 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 C12orf40Q86WS4 652 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MYEOVQ96EZ4 313 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 P2RY11Q96G91 374 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PDLIM2Q96JY6 352 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D17Q9HA65 648 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PCSK1NQ9UHG2 260 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 VANGL2Q9ULK5 521 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 SNX10Q9Y5X0 201 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 GFRA2O00451 464 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 TBL1XO60907 577 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 LRCH4O75427 683 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 OPRD1P41143 372 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 SLC6A11P48066 632 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 AUHQ13825 339 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP52Q8N1V2 620 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 FLCNQ8NFG4 579 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 HAPLN3Q96S86 360 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 STIM2Q9P246 746 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 KANSL1LA0AUZ9 987 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 RCCD1A6NED2 376 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 SHISA7A6NL88 538 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PRPSAP2O60256 369 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 PENKP01210 267 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 MIPP30301 263 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 GALK1P51570 392 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 VAV2P52735 878 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 RPS24P62847 133 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXD4-201ENST00000306324 CCZ1BP86790 482 aa23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms