RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 CHSY1Q86X52 802 aa23.64■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 RHOT2Q8IXI1 618 aa23.64■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCDC185Q8N715 623 aa23.64■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 MYEOVQ96EZ4 313 aa23.64■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 SIK2Q9H0K1 926 aa23.64■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 IP6K2Q9UHH9 426 aa23.64■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 HS3ST4Q9Y661 456 aa23.64■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 COL4A3Q01955 1670 aa23.63■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 COL4A2P08572 1712 aa23.63■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 GFRA2O00451 464 aa23.63■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 ARHGAP6O43182 974 aa23.63■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 RNF8O76064 485 aa23.63■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 CD72P21854 359 aa23.63■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 SGSHP51688 502 aa23.63■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 GAD2Q05329 585 aa23.63■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 GAB4Q2WGN9 574 aa23.63■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 TRIM67Q6ZTA4 783 aa23.63■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 SNX10Q9Y5X0 201 aa23.63■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 LRCH4O75427 683 aa23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 TYRP14679 529 aa23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 TACR2P21452 398 aa23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 ADRA1BP35368 520 aa23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 KRT83P78385 493 aa23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 FYB2Q5VWT5 728 aa23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 TXNDC11Q6PKC3 985 aa23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 NAT16Q8N8M0 369 aa23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 DDI1Q8WTU0 396 aa23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 MARK1Q9P0L2 795 aa23.62■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 SHISA7A6NL88 538 aa23.61■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 CYBBP04839 570 aa23.61■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 VAV2P52735 878 aa23.61■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 MTA1Q13330 715 aa23.61■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 ARL13BQ3SXY8 428 aa23.61■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 KIAA1328Q86T90 577 aa23.61■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 C12orf40Q86WS4 652 aa23.61■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 LGI2Q8N0V4 545 aa23.61■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 PCSK1NQ9UHG2 260 aa23.61■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 GLULP15104 373 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 MIPP30301 263 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 PRKCQQ04759 706 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 AUHQ13825 339 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 ACAP1Q15027 740 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 MPPE1Q53F39 396 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 NIPA2Q8N8Q9 360 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 HAPLN3Q96S86 360 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 MAGEB5Q9BZ81 275 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 LACRTQ9GZZ8 138 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 VANGL2Q9ULK5 521 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 A0A0U1RQJ8 604 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 F5H5T6 163 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 NRDCO43847 1150 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 MTA2O94776 668 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 PENKP01210 267 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 RPS24P62847 133 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 MESDQ14696 234 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 FBXL22Q6P050 247 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLFN11Q7Z7L1 901 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 C14orf80Q86SX3 495 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 CPNE8Q86YQ8 564 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 CFAP52Q8N1V2 620 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 NTAN1Q96AB6 310 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 PEBP4Q96S96 227 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 ADGRG1Q9Y653 693 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 DUSP10Q9Y6W6 482 aa23.6■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 PROSCO94903 275 aa23.59■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 TCF4P15884 667 aa23.59■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 OPRD1P41143 372 aa23.59■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC6A11P48066 632 aa23.59■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 AMPD2Q01433 879 aa23.59■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 TCEAL1Q15170 157 aa23.59■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM3CQ92520 227 aa23.59■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 SHDQ96IW2 340 aa23.59■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 STIM2Q9P246 746 aa23.59■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.59■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 PRPSAP2O60256 369 aa23.58■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 TBL1XO60907 577 aa23.58■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 PCK1P35558 622 aa23.58■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 STARD6P59095 220 aa23.58■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 PON2Q15165 354 aa23.58■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF852Q6ZMS4 543 aa23.58■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa23.58■■□□□ 1.37
SIGMAR1-201ENST00000277010 MSANTD3Q96H12 275 aa23.58■■□□□ 1.37
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