RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 E5RJQ4 531 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DAB1O75553 588 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PDHA1P08559 390 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 VHLP40337 213 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SKOR1P84550 965 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KCNMB4Q86W47 210 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ALLCQ8N6M5 410 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SENP8Q96LD8 212 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF670Q9BS34 389 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RAD18Q9NS91 495 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CLUHO75153 1309 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 LCA5LO95447 670 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ITGB5P18084 799 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TUBP50607 506 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 AMPD2Q01433 879 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 WASHC5Q12768 1159 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ECM1Q16610 540 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RETSATQ6NUM9 610 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 WDR59Q6PJI9 974 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TAGAPQ8N103 731 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 HES6Q96HZ4 224 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 HEY2Q9UBP5 337 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SOX13Q9UN79 622 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 LIASO43766 372 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PFDN1O60925 122 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PTPN7P35236 360 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINB10P48595 397 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FMO1Q01740 532 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF844Q08AG5 666 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZACNQ401N2 412 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ARSHQ5FYA8 562 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 WLSQ5T9L3 541 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RIN3Q8TB24 985 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DDI1Q8WTU0 396 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 JADE3Q92613 823 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RNF103O00237 685 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINE1P05121 402 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NFICP08651 508 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ELK3P41970 407 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 HASPINQ8TF76 798 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 GPAMQ9HCL2 828 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DNPEPQ9ULA0 475 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ACADSP16219 412 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 IL31RAQ8NI17 732 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 EME1Q96AY2 570 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SH3GL1Q99961 368 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 WDR27A2RRH5 827 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TGFB1I1O43294 461 aa6.62□□□□□ -1.35
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