RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa12.66□□□□□ -0.38
CTIF-208ENST00000590422 TMEM131Q92545 1883 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-208ENST00000590422 TRIM49BA6NDI0 452 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-208ENST00000590422 YJEFN3A6XGL0 299 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-208ENST00000590422 E7ENQ6 273 aa12.65□□□□□ -0.38
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CTIF-208ENST00000590422 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CTIF-208ENST00000590422 CETN3O15182 167 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-208ENST00000590422 SH3BP5O60239 455 aa12.65□□□□□ -0.38
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CTIF-208ENST00000590422 HLA-FP30511 346 aa12.65□□□□□ -0.38
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CTIF-208ENST00000590422 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa12.65□□□□□ -0.38
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CTIF-208ENST00000590422 ZNF366Q8N895 744 aa12.65□□□□□ -0.38
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CTIF-208ENST00000590422 SIPA1Q96FS4 1042 aa12.65□□□□□ -0.38
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CTIF-208ENST00000590422 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CTIF-208ENST00000590422 IL21RQ9HBE5 538 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-208ENST00000590422 ITM2CQ9NQX7 267 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-208ENST00000590422 COQ4Q9Y3A0 265 aa12.65□□□□□ -0.38
CTIF-208ENST00000590422 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa12.64□□□□□ -0.39
CTIF-208ENST00000590422 PTPRBP23467 1997 aa12.64□□□□□ -0.39
CTIF-208ENST00000590422 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
CTIF-208ENST00000590422 TMEM8BA6NDV4 472 aa12.64□□□□□ -0.39
CTIF-208ENST00000590422 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
CTIF-208ENST00000590422 NPC1O15118 1278 aa12.64□□□□□ -0.39
CTIF-208ENST00000590422 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
CTIF-208ENST00000590422 STX10O60499 249 aa12.64□□□□□ -0.39
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CTIF-208ENST00000590422 LRMPQ12912 555 aa12.64□□□□□ -0.39
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CTIF-208ENST00000590422 WFDC5Q8TCV5 224 aa12.64□□□□□ -0.39
CTIF-208ENST00000590422 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa12.64□□□□□ -0.39
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CTIF-208ENST00000590422 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
CTIF-208ENST00000590422 SLC35C1Q96A29 364 aa12.64□□□□□ -0.39
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CTIF-208ENST00000590422 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa12.64□□□□□ -0.39
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CTIF-208ENST00000590422 KAT5Q92993 513 aa12.63□□□□□ -0.39
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CTIF-208ENST00000590422 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
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CTIF-208ENST00000590422 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa12.63□□□□□ -0.39
CTIF-208ENST00000590422 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
CTIF-208ENST00000590422 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CTIF-208ENST00000590422 APC2O95996 2303 aa12.62□□□□□ -0.39
CTIF-208ENST00000590422 DSPP15924 2871 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
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